偶然的手淫对身体没有影响，但如果自慰过度容易引发男性生殖系统感染，导致慢性前列腺炎、尿道炎、睾丸炎、遗精频繁等疾病，还可能导致早泄、阳痿、不射精等性功能障碍，会影响日后的生育.一定要节制。
自慰有可能会引起盆腔炎等疾病，会造成性冷淡或正常性交无法得到性满足，如果频繁自慰，很可能会导致肝肾不足，表现为腰膝酸软，耳聋耳鸣，记忆力减退，学习专注下降。改变这种不良习惯，加强体育锻炼，多看书，培养积极的兴趣，转意注意力，不要穿过紧的衣裤，所以不要过度自慰，保持良好的生活习惯。
遗传因素阴茎与身体其他器官一样,其大小及形态特点要受遗传基因的控制与影响。发育与营养状况一般来说,成年男性体格健壮,身材高大,其外生殖器包括阴茎、阴囊的发育也较好,阴茎可能较为粗大;反之,则可能相对小一些.但必须提醒的是,阴茎的大小并不与身高成正比例。肥胖男性肥胖是造成阴经短小的又一因素,一些耻骨联合部、会阴部脂肪丰满突出的男性,往往阴经发育欠佳,比起正常男性的阴茎会相对短小。其他患有睾丸炎、隐睾症、睾丸发育不全等症及内分泌不平衡,雄性激素不足,都可能造成阴茎短小。
长期自慰会导致不孕，长期自慰会导致肾精亏损，容易疲劳，脱发，秃顶，腰膝酸软，气短，乏力，耳鸣，头疼等。如果使用工具自慰，还可能会导致盆腔炎症，卵巢储备功能下降，所以不容易怀孕。
孕早期自慰一般是不好的。
在妊娠初期，胎儿处于最不稳定的状态，如果自慰的话，可能会引起子宫平滑肌的萎缩，从而引起先兆流产。此外，孕妇身体抵抗力较差，如果这时候有自慰的习惯，会导致生殖器的充血和肿胀，从而导致生殖器的感染。因此，在妊娠初期和生产的三个多月内，一定要避免自慰。做好怀孕期间的健康管理，合理的营养膳食，做好孕检和各种检查。
姨妈期间通常是不能自慰的，并且也需要禁止性生活。首先，女性月经期间阴道可能会有持续出血的症状，如果进行自慰或者性生活，相对较为不卫生。其次，女性在月经期，整个盆腔可能会处于充血水肿状态，进行自慰或者性生活，都容易造成女性机体损伤，进而出现腰痛、腹胀、下腹坠痛不适等症状。同时月经期间经血属于病原菌良好的培养基，在月经期间，机体免疫力处于低下状态，抵抗力差，容易诱发致病菌感染。
