一般情况下，五岁男孩发烧39度，可以通过药物治疗、物理治疗、日常护理等方法进行治疗。具体分析如下：
1.药物治疗：五岁男孩发烧39度，属于高热的范畴，家长可以在医生的指导下使用布洛芬混悬液、对乙酰氨基酚混悬滴剂、小儿豉翘清热颗粒等药物给宝宝治疗。
2.物理治疗：五岁男孩发烧39度，可以用冰块冷敷额头、温水擦浴、贴退热贴等，达到物理降温的效果，但要注意的是，退热的同时要观察孩子的精神状态。
3.日常护理：平时多带孩子进行体育锻炼，具有增强体质的效果，还要多晒太阳。
这个发烧39度，一定要注意及时到医院去就诊，检查。超过38.5度，需要服用退烧药的，而且的话要注意给孩子多喝水，洗个温水澡。考虑是因为有炎症导致的。可以做一个血常规的检查，注意积极治疗的，多休息，避免过度劳累的，避免辛辣刺激性的食物。
孩子发烧尤其是高烧，不及时退热治疗可能会造成对大脑的损伤。中药退烧药相对安全,除退热外,还能起到抗菌抗病毒的作用，改善咳痰、咳嗽、咽部症状疗效优于西药。快速退烧同时标本兼治，防止宝宝反复发烧。
孩子发热，多数由于病毒感染引起，也有可能出现急性扁桃体炎。可以给予消炎药服用。如果体温仍然不退，到医院做个血常规检查。饮食宜清淡，多饮水，忌食辛辣生冷刺激食物。注意保暖。
属于病毒感染引起的感冒造成的，和着凉或者是炎症感染都是有关系的，要及时治疗。可以服用退烧药同时采用物理方法来降温，多喝水，同时要注意根据检查的情况来进行抗炎或是抗病毒治疗为好的，有利于身体的恢复。平时增强体质，增加抵抗力。
