疱疹性咽炎主要是有疱疹病毒感染而引起的，有效的治疗方法为抗病毒治疗，如果发烧不超过39度，可以使用物理降温，用毛巾包裹冰袋放于腋下或腹股沟处，如果发烧超过39度，可以使用药物治疗。
小儿疱疹性咽炎一般指小儿疱疹性咽峡炎，通常来说，小儿疱疹性咽峡炎治疗一周左右能好。
小儿疱疹性咽峡炎是一种特殊类型的上呼吸道感染，病原体为柯萨奇A组病毒，常继发于急性鼻炎、肺炎、流行性感冒、疟疾、流行性脑膜炎，亦可单独发生，感染性较强，但不是传染病，好发于夏秋季，起病急骤，临床表现为高热、咽痛、流涎、厌食、呕吐等，而这种疾病一般可以使用利巴韦林颗粒、蓝芩口服液等药物进行治疗，通常一周左右能好。
儿童疱疹性咽炎，是由柯萨奇病毒a型感染所致的一种上呼吸道感染。儿童疱疹性咽炎发病急，症状主要有反复发烧、咽痛、流涎、食欲减退、烦躁、精神不佳等症状，还会出现颌下、颈部、耳后等局部淋巴结肿大、疼痛。
上颚会出现一团或一团的小疱疹，约2毫米，周围有红色斑点，1-2天后会破裂，形成一个小型的溃疡。儿童患有疱疹性咽炎时要注意多休息、多通风、多饮水、少吃东西、保持口腔清洁。
小儿咽炎疱疹会持续3至5天，婴幼儿疱疹性咽峡炎多由病毒感染引起，一般治疗时间在3到5天左右。如果食欲较差患儿需要通过静脉输液来补充营养。也可以适当的清热解毒，利咽消肿。再加用雾化抗病毒，增强抵抗力。疱疹性咽炎主要的原因是由于病毒感染，上火导致的，一定要在医生的指导下用一些药物进行治疗，一定要让孩子多喝一些白开水，有利于新陈代谢毒物的排出，同时饮食上也一定要以清淡为主。
能，减少接触肥皂，碱，洗衣粉，洗涤灵，汽油，酒精等物；保持情怀畅达，避免七情不遂；不要用手撕脱脱皮，以防染毒成脓。多吃有健脾除湿功效的蔬菜，水果，甘薯，冬瓜，西瓜，南瓜。少吃辛辣厚味，肥甘酒酪。其他。
