新生儿在出生后要打的是卡介苗和乙型肝炎，在生后三日就要进行皮下注射。
如有皮肤的病变、发烧等早产儿，可以暂时停止使用卡介苗，因为有可能存在先天免疫障碍的婴儿不能打卡介苗，以免引起身体的全面感染。在出生24小时以内注射乙型肝炎，第二、三次注射分别为1-6个月。如果母亲是乙肝病毒携带者，那么孩子出生后6个小时内要注射100个单位的高质量的乙肝免疫球蛋白，还要打乙肝疫苗。
为了有效的预防乙肝病毒的传染，乙肝疫苗的免疫接种纳入基础的接种范围以内，孩子出生以后，按照0-1-6月份的时间进行正规的疫苗接种。新生儿的母亲是乙肝病毒感染者，尤其是大三阳的患者，孩子出生以后，除了正规进行疫苗的接种，还需要使用乙肝高效价免疫球蛋白，一般在出生后24小时内尽早使用，然后在半个月以及一个月的时候，分别再次使用，可以有效的预防乙肝病毒的垂直传染的发生。
新生儿接种乙肝疫苗的时间为出生后24小时内接种第一次，然后分别在1月龄、6月龄的时候再次接种，共3次。乙肝疫苗接种同样有一定的禁忌证，如携带乙肝病毒、对疫苗的成分过敏、患有神经系统疾病、重度营养不良、先天性免疫功能缺陷、正在使用免疫抑制剂等人群禁止接种乙肝疫苗。
第二针乙肝疫苗接种时间在一个月的时候接种，第二针六个月的时候接种第三针。第一针疫苗和第二针疫苗，主要是起到产生抗体的作用，应是不要推迟，第二针疫苗推迟的话也不要推迟超过一周。按时间去接种相关疫苗。
新生儿出生24小时内接种乙肝疫苗，常规的乙肝疫苗注射是016方案。
新生儿在出生24小时之内，要及时的接种第1针乙肝疫苗。如果出生24小时之后这种乙肝疫苗会影响到疫苗的预防效果。一个月和六个月的时候分别再注射后面的两针。若母亲是乙肝感染者，出生婴幼儿是低产儿、低体重儿在出生后更要加强一针，需分别在0、1、2、6个月注射乙肝疫苗。
乙肝疫苗对婴儿来说，出生的时候医院就会给打第一针，然后，在孩子满月也就是一个月的时候，打第二针，再然后，就是等到孩子长到6个月的时候打第三针，打乙肝疫苗的时间也就是说的0，1，6月。
