无痛胃镜和普通胃镜都有一定的风险，但是无痛胃镜的风险相对更高。
无痛胃镜和普通胃镜都是一种侵犯性的检查，是一种有创的检测方法，都存在一定的风险。无痛胃镜疼痛感较轻，也不会引起咽部对抗反，但是无痛胃镜的病人，可能会因为芬太尼和异泊酚的作用而陷入深度睡眠迷，出现抑制呼吸的现象，在检测的时候，会发生误吸和坠积性的肺炎。因此，无痛胃镜的风险相对更高。
无痛胃镜门诊医保是报销的。但是住院检查，如果是在职职工，大约可能报到70%左右。无痛胃镜具有没有痛苦的优点，检查过程中，病人没有任何不舒服，能消除病人的紧张情绪，消除病人对胃镜检查的恐惧心理。
痛胃镜的副作用是比较小，主要是对咽喉部和消化道黏膜的损伤。无痛胃镜和普通胃镜的区别是无痛胃镜是在全麻的情况下进行，患者感觉不到痛苦，胃镜的前端穿越咽喉部时没有抵抗，减轻了对局部组织的损伤，但是也会对消化道黏膜造成轻度的损伤。
患者需要注意的是，应在专业医生的指导下进行检查，在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。
无论是无痛胃镜还是普通胃镜，都存在着一定的危险性，而且会对身体产生一定的危害。因为无痛胃镜是在全身麻醉下行进行的，因此有可能会引起恶心、呕吐、呼吸困难等副作用，因此在做检查之前应该先禁食水8个小时。此外，在检查时，可能会对胃、食道、十二指肠粘膜造成损伤，甚至有可能造成食道、胃、十二指肠粘膜破裂出血。
无痛胃镜肠镜有危险，具体分析如下：
首先，就是麻醉的风险，虽然是速效麻醉剂，但如果用药不当，很可能会出现精神错乱、烦躁、缺氧缺血性脑病、植物状态、死亡等。另外，与普通胃肠镜相比，因为缺乏沟通，所以在手术中，肠镜会出现充气过多、进镜速度过快，从而增加肠穿孔和系膜的过度牵扯。这就要求有熟练的麻醉师和内窥镜医生配合，才能进行无痛胃肠镜检查。
