肝脏磁共振检查通常是用于肝脏内的肿块性质不明确时进行的，临床上对于肝脏内常规检查是做B超来检查的，但B超检查发现的肿块又性质不明确的，需进行磁共振检查并进行增强扫描，大致方法是通过磁共振检查后注射显影剂，观察肿块对显影剂的吸收和显影程度来判断性质。磁共振检查时不要戴金属，不要活动。
头颅磁共振可以检查脑血管病、脑炎、脑肿瘤、脑外伤、脱髓鞘疾病、神经系统变性病等。头颅磁共振可以做血管成像，主要可用于颅内血管狭窄或闭塞、颅内动脉瘤、脑血管畸形的诊断。磁共振能显示人体任意断面的解剖结构，可以提供冠状位、矢状位和横位三维图像，清楚显示脑干小脑等后颅窝病变。
核磁共振检查是脊柱系统疾病的一种非常常见的辅助检查方式，由于对软组织以及骨骼系统均有良好的成像效果，所以，主要用于检查脊柱脊髓神经以及周围软组织的病变。磁共振对于脊柱系统疾病的检查范围非常广泛，胸椎磁共振检查主要用于胸椎结核，胸椎的骨折脱位，胸椎段脊髓神经的病变以及损伤，胸椎及胸椎周围的良恶性肿瘤、转移瘤以及胸椎周围软组织、韧带的急慢性损伤等。
核磁共振可以帮助诊断是否患有颈椎病，颈椎病通常会引起病人颈椎部位僵硬，还会导致活动受到限制，颈椎病会压迫病人的神经，因此会有头晕和头痛的情况，还会导致局部血液循环不通畅，经常按摩颈部促进血液循环。
脑磁共振检查可以检查出大多数的脑部疾病。通过脑磁共振检查，可以详细分析脑部各个组织是否出现病变，因此是非常重要的一个脑部疾病的检查方法。脑部磁共振检查可以检查很多疾病:第一,脑血管的疾病,包括脑出血、脑梗死、脑血管畸形、脑动脉瘤、脑血流灌注异常。如果患者出现不适症状，建议及时去医院就诊，通过专业检查，明确具体情况，对症治疗。
腰椎核磁共振是通过对脊柱矢状面的不同层面和所累及椎间盘的横断面影像进行观察分析，可以直观清晰观察椎间盘突出的部位、程度、形态及其与硬膜囊、神经根等周围组织的关系，对排除炎症、肿瘤等其他病变时优于X线和CT，能清晰的看到突出椎间盘是否出现游离、脱垂，对于术前进行术区定位和手术方法的制定有重要的参考意义。
