卵巢囊肿会导致CA125增高，CA125是一种常见于卵巢上皮癌的肿瘤标志物，这种病人在检查时会出现CA125高于正常值。但在某些特定的条件下，也会引起盆腔炎、子宫内膜异位症、卵巢囊肿等疾病，特别是50岁以下的女性，CA125增高并不一定就是卵巢癌。女性50岁以上的女性，CA125水平增高，需要密切关注。
一般情况下，良性卵巢囊肿可能会导致CA125轻微升高，具体分析如下：
良性卵巢囊肿有可能会导致CA125出现轻度升高，一般是由于卵巢巧克力囊肿导致的。结合病史，如果有痛经的病史并且进行性加重，还可能会不孕不育，另外半个月再复查的时CA125值没有改变，基本上就可以考虑是卵巢巧克力囊肿。
对于卵巢巧克力囊肿患者，建议尽快手术治疗，术后为了预防复发还要用相应的药物，连续用药三个月经周期或半年的时间。
如果患者的卵巢囊肿是恶性的，则CA125值通常会升高，但良性的卵巢囊肿，一般则不会导致CA125值升高。
CA125值是一种肿瘤标志物，但不可仅凭此就将其用于诊断肿瘤，在某些良性疾病中，CA125值也会升高。CA125值一般观测卵巢癌患者的术后检查，如果患者在术后，CA125值水平降至正常，复查时又出现重新升高的现象，则表明患者可能出现复发的情况。
不一定，CA125的特点是敏感性高，也就是说体内只要有些风吹草动，它可能就会升高，但是它的特异性差，除了真正的妇产科肿瘤，包括卵巢癌、输卵管癌、子宫内膜癌、宫颈癌会有增高，其他部位的恶性肿瘤，例如胰腺癌、肠癌、乳腺癌和肺癌也会增高。
这类物质会随着血液循环在身体各处游走，不同的肿瘤所表达出来的大分子物质可能会有一些差异，所以，在化验的过程中抽取患者的外周血液，在血液当中寻找肿瘤表达出来的大分子水平，就可以间接的推测身体中有没有肿瘤，或者肿瘤在身体当中的变化情况。
CA125血清小于35U/ml为卵巢癌。上皮性的卵巢癌抗原检测出，可被单克隆抗体OC125结合的糖蛋白，是来源于胚胎发育期体腔上皮，而在正常的卵巢组织当中是不存在的。最常见也就是上皮性的卵巢肿瘤，也就是浆液性肿瘤患者的血清当中，其诊断的敏感性较高，但是特异性较差。
