流脑是由于细菌感染的脑膜炎症，乙脑是由于病毒感染的脑实质的病变，也就是大脑炎。两种疾病所使用的药物是明显不同的，流脑通过自己的治疗，会完全康复的，大脑炎的病症比较严重，通过治疗部分患者，未留有后遗症状。
脑膜炎双球菌疫苗就是流脑疫苗，并不是乙脑疫苗，不能混为一谈，其实乙脑也就是们所俗称的流行性乙型脑炎。注射流脑疫苗是为了预防流行性脑脊髓膜炎。所以脑膜炎双球菌是流脑。
癫痫不可以接种乙脑、流脑、白破这类的疫苗。癫痫是大脑皮层异常放电所致的临床综合征，其临床表现特点为发作性、短暂性、重复性和刻板性。癫痫是神经系统的常见疾病，癫痫不是一个独立的疾病，而是一组疾病或综合征。
乙脑可以治疗好，但是仍然有一定的死亡率，部分病例可能留有严重的后遗症。流行性乙型脑炎是由乙型脑炎病毒感染所引起的以脑实质炎症为主要病变的急性传染病。
乙脑的症状，主要包括潜伏期的症状、初期的症状、极期的症状以及恢复期的症状。潜伏期大约为2-3周，没有很典型的症状。在初期，大约3-5天，主要表现为发热、头疼、呕吐、呼吸道症状。
乙脑（减毒）疫苗和乙脑疫苗的区别，疫苗是一种病毒，而乙脑疫苗中的细菌经过技术处理完全丧失活性，而乙脑减毒疫苗仍保留一定的毒力但不足以致病，但缺点是免疫缺陷的人接种可能会导致意外，所以理论上灭活疫苗安全性更高，减毒疫苗免疫效果更好。