二甲双胍主要的副作用是胃肠道的反应，如恶心、腹部不适、腹泻。还有极少数患者可出现皮疹、荨麻疹。二甲双胍可以抗血小板聚集、降脂，但要掌握好它的禁忌症，如有严重的肝肾功能不全的糖尿病、严重感染缺氧、接受大手术的患者，暂时不要使用。
二甲双胍为良好降糖药，特别适用于肥胖二型糖尿病病人，为首选用药，由于这类群体使用二甲双胍会导致体重减轻，但正常人不推荐二甲双胍来减肥。
由于一些研究显示，一定要做到每日1000毫克以上剂量，才能起到减肥的作用。所以二甲双胍在治疗肥胖症时需要根据不同体质和个体差异来选择用药方案，如果使用过量就可能导致严重不良反应。大幅度加大用量，其副作用亦随之加大。
不建议用二甲双胍来减肥。二甲双胍是一种双胍类降糖药物。二甲双胍用于单纯饮食和体育运动不能有效控制血糖的2型糖尿病患者。二甲双胍虽然有一定的减肥作用，但是效果并不明显。减肥时要管住嘴迈开腿，可以通过跑步锻炼、快走等运动方式来减少多余脂肪，坚持锻炼效果明显。同时要养成良好的生活习惯，避免熬夜、喝酒、抽烟等。
孕期吃二甲双胍对宝宝没有影响：
怀孕可以服用二甲双胍，但在临床上要根据具体情况决定。怀孕前病人若患有多囊卵巢综合征或者糖尿病，医生可能会建议服用二甲双胍。但在明确怀孕后，尤其是早孕阶段，一般情况下不建议孕妇服用二甲双胍。根据国家和国际糖尿病合并妊娠指南，以及糖尿病管理指南，在孕期针对糖尿病合并妊娠，或者妊娠期糖尿病病人。
如果患者的肝、肾功能不好，服用二甲双胍会对肝脏和肾脏造成一定的影响。如果是肝肾功能正常的人，服用二甲双胍对肝脏和肾脏的作用并不大。
二甲双胍一般属于降血糖药物，最常见的是片剂和胶囊剂。对于II型糖尿病患者，如果是单纯的饮食控制不佳，可以降低血糖和脂肪含量。如果是肝、肾功能不好，服用二甲双胍会对肝、肾功能造成一定的影响，导致肝脏和肾脏的机能下降，从而导致乳酸酸中毒。