巧克力囊肿确诊良性还是恶性应该予以手术探查的，囊肿切除之后立刻在手术室里进行冷冻切片显微化验，以确定囊肿是属良性或恶性。这种囊肿可以逐渐增大，有时会在经期或经后发生破裂，但很少发生恶变。
巧克力囊肿是子宫内膜异位到卵巢上形成的，对怀孕有影响。如果引起了月经不调等症状需要手术治疗。巧克力囊肿主要是由于卵巢功能异常，内分泌失调而导致，现在月经期时间长，颜色发黑，需考虑存在了月经不调。
另外从发病机理到临床表现都可以观察到本病症属于比较复杂的症状，对于女性朋友常说的巧克力囊肿7cm大小一定要引起适当重视，饮食尽量不要吃辣椒海鲜等刺激性食物，以此告诫广大女性要对饮食方面对注意。
孩子可以要，怀孕以后受体内激素影响，囊肿有继续长大的可能，适当休息，不要进行剧烈活动，加强营养，不要吃辛辣刺激性食物，不要吃垃圾食品，不要吃烧烤食物和霉变食物，精神放松，定期复查，密切关注宝宝，发育情况正常就不用担心了。
腔镜手术治疗巧克力囊肿大多数人都是可以的，腹腔镜检查手术治疗能比较彻底的治疗巧克力囊肿，手术的效果要巧克力囊肿穿刺效果要好很多，术后第二个月就可以开始备孕，生孩子具体的手术费用因为各地的消费不同，费用的问题当地医院的主治医生。
左侧巧克力囊肿3cm可以用药物治疗。一般卵巢囊肿都是属于良性的病变。建议多注意观察，如果长期不能恢复，建议采取手术治疗。卵巢囊肿和个人的激素水平有很大的关系。建议根据个人的实际情况，听取医院主治医生的建议，做出进一步的判断。
