一般情况下，谷氨酰转移酶升高的话，表示肝细胞有损害，肝功能受到影响了。内科疾病有脂肪肝、酒精肝、肝硬化以及心肌疾病、肾脏疾病、免疫系统疾病，这些疾病都可以造成肝脏内源性的问题，导致谷酰转肽酶升高。
当然也有一些外科疾病，包括胆道梗阻、胆道结石，胆道肿瘤、肝脏占位性病变，以及一些肿瘤的晚期，都能够造成谷氨酰转移酶的偏高。
不能仅凭谷氨酰转肽酶的数值来判断疾病的严重程度，有些谷氨酰转肽酶数值达到200并不严重，经过治疗后完全能够康复，而有些谷氨酰转肽酶的数值达到200，有可能是乙肝、肝硬化甚至是原发性肝癌、胆管癌等恶性肿瘤所致成的。这些疾病都是比较严重的病变。
碱性磷酸酶和谷氨酰转肽酶高偏高时说明肝脏有损，可以进一步去医院做超声或ct检查，如果服用其他的药物，也有可能会引起药物性肝损害，但是主要是以转氨酶升高为主。
儿童碱性磷酸酶升高可能时生理现象，也可能时肝脏病变导致的。
孩子体内的碱性磷酸酶活性一般是一种生理上的增高，孩子在骨骼生长的过程中，体内的碱性磷酸盐活性要高于正常的孩子一到两倍，所以在青春期的孩子体内，这种现象会导致体内的碱磷酸酶水平上升。同时也可能是由于其他原因引起的，比如骨头和肝脏等。当出现了黄疸、肝胆、骨头等方面的症状时，可以做出明确的诊断，此外，肝胆类疾病，比如肝外胆路堵塞，肝癌、肝硬化等，都会引起体内的酸性磷酸酶增高。
需要进一步完善腹部彩超检查。如果是胆道系统的炎症或者胆道结石引起的，需要进一步到肝胆科治疗；如果是胆道结石引起的，必要时有可能需要手术治疗；如果是胆道炎症引起的，可能需要抗感染治疗。
如果肝功能异常主要以谷氨酰转肽酶和碱性磷酸酶升高为主，那么主要病变在胆管，最常见的原因是结石引起的胆道梗阻，梗阻后引起肝脏本身轻度损害，故同时也可以见到谷丙转氨酶和谷草转氨酶的轻度升高，如果肝功异常主要以谷丙转氨酶和谷草转氨酶为主。
