如果是肝脏的囊肿比较小，不需要特别的治疗，可以定时进行检查。但若囊肿大且有挤压感，应立即进行囊肿开窗手术。如有炎症、囊液中有胆汁，应在开窗手术后进行导管引流。若有多囊肝脏的征象，应尽早进行肝脏移植。在日常生活中要注意保持情绪的放松，不要过于紧张和焦躁。另外还要注意多做一些运动，比如慢跑、游泳等，有助于改善症状。
肝囊肿手术住院时间，主要取决于疾病情况，手术方式以及手术恢复过程。比如简单的单发性肝囊肿，一般要经过完善相关的检查后，进行肝囊肿的腹腔镜开窗手术，手术过程也很顺利，恢复也很好2天-3天甚至就可以出院。
肝囊肿手术主要是在腹腔镜下开创引流术，主要是将肝囊肿的囊壁打开，让囊液流出来达到治疗的目的，还有是肝囊肿的穿刺引流术，穿刺引流术容易囊肿复发，比开创引流术效果要差一些。
肝囊肿手术需要住院，病人可以选择做微创手术，但是手术都是需要住院的，手术以及病人自身的情况不一样，住院的时间也不一样。大多数都是十天。病人可以做适度的体育锻炼，有利于恢复。
肝囊肿穿刺治疗是需要住院的，3天左右即可，手术以后很有可能囊肿会再次增大，需再次手术，如果囊肿出现严重的并发症，需要切除囊肿的。保证休息充足，勿过度运动，要注意自身身体的变化，要及时到正规医院做检查并确诊，要积极配合医生治疗。
肝囊肿手术需要住院的，临床上最常见的肝囊肿手术方式是肝囊肿开窗引流，住院时间可能需要5天左右。然也有少数需要将病灶完整切除，甚至还有可能行规则性的肝叶或者肝段切除术。5到7天也能够出现出院。而如果采取开放手术方式恢复相对较慢，可能需要7到10天。
