支原体感染为目前尿道感染中常见微生物种类，包括解脲支原体、人型支原体等，通常都使用抗生素治疗。
支原体感染建议口服药物以大环内酯类药物为主，代表性药物有阿奇霉素分散片、盐酸多西环素胶囊等。若上述药物没有用处，身体无法承受副作用，亦可换成琥乙红霉素片治疗。
通常情况下，儿童支原体感染服用中药是无效的。对于治疗支原体感染，最直接有效的办法就是使用大环内酯类抗生素来控制感染，最常见的是阿奇霉素分散片、罗红霉素分散片，如果孩子出现发烧的情况，可以通过静脉注射阿奇霉素。
中医不能直接治疗支原体感染，可以口服银黄颗粒、复方金银花颗粒、小儿双黄连口服液等清热解毒的中成药。
肺炎支原体以一种比较复杂的肺部炎症，发病之后的症状是比较明显的，会给患者带来发热，咳嗽以及咽痛等症状，肺炎支原体感染之后可以使用盐酸米诺环素胶囊，治疗支原体感染，同时阿莫西林胶囊也能改善呼吸急促，咳嗽等不适症状。患者也可使用养阴清肺丸来起到养阴润燥，清肺利咽的疗效，能够很好的改善干咳，少痰等表现。
一般在急性感染期可选择抗支原体抗病菌类药物，急性感染期过后可选择汤药，需要注意的是，治疗时应进行辨证论治。支原体感染性咳嗽，多见于支原体气管炎和支原体肺炎等病症，以药物治疗为主。
支原体感染可给予喹诺酮类抗生素口服。
喹诺酮类抗生素有盐酸莫西沙星片，盐酸左氧氟沙星片等，支原体感染也可以服用大环内酯类抗生素，如阿奇霉素片等，以控制感染。支原体是一种微生物，导致肺部感染后，病人通常会出现发烧、刺激性干咳，疲乏无力，浑身难受，胸痛，严重时，可有较多脓痰和耳疼痛等肺外表现、关节疼痛等。
女性支原体感染建议吃大环内酯类和氟喹诺酮类药物。
1、大环内酯类：常用的药物为红霉素肠溶片、罗红霉素分散片等，起到抵抗支原体的作用。
2、喹诺酮类：如盐酸左氧氟沙星胶囊、诺氟沙星片以及盐酸环丙沙星片等，该类药物对于治疗支原体的感染效果较好，患者可以遵医嘱选择。
