盆腔脓肿治疗以切开引流或将脓肿切除为主。选用有效抗生素，手术治疗主要用于抗生素控制不满意的输卵管卵巢脓肿或盆腔脓肿。可根据情况选择经腹手术或腹腔镜手术，注意性生活卫生，减少性传播疾病。
肛周脓肿手术后、不要急着运动，要等伤口愈合后才可以进行运动，要适当的运动，增强抵抗力，肛周脓肿手术后，可以在床边自己走走，不然剧烈的运动会使伤口开裂的、病人会出现疼痛，一系列的症状的出现，手术后要注意休息等愈合后就可以适当的运动了。肛周脓肿术后提肛运动可以存进肛门部位的肌肉收缩促进血液循环，对愈合有好处，但是不用一直做。
需要应用抗生素治疗来促进炎症消退，另外可以进行细菌培养和药敏试验检查，检查结果选择敏感的抗生素，如果出现进一步加重，需要进行手术处理，切除脓肿，导致出现脑炎或脑膜炎，可以进行腰大池引流治疗。
肛周脓肿不能用百多邦治疗，因为肛周脓肿是指在肛门和直肠周围的软组织间隙中发生的化脓性严重的感染，其最常见的表现为肛周局部红肿硬结，逐渐发展痛疼，甚至摶动性痛，一旦形成肛周脓肿，除部分破溃形成肛瘘外，多需要手术治疗。
对于肛周脓肿如果没有化脓，单纯炎症可以先行药物治疗，包括局部用药及口服或输入消炎药治疗，另外注意饮食，避免进食辛辣食物，避免久坐等。如果已经化脓，应该手术切开引流，术后再应用消炎药治疗。
