主要有胃肠道反应，肾脏损害，出汗、凝血功能障碍等，要减轻胃肠道的反应，可在饭前吃入药物，或食入含维生素的水果以减轻反应，吃药后多饮水，以促进药物的排泄，以减轻胃肠道反应。
接种甲肝疫苗出现不良反应不需要做特殊的处理，两天内就可以自行缓解。甲肝疫苗的不良反应是比较少的，个别在注射后可以出现注射部位局部的疼痛、红肿。全身性的反应有头痛、发热、疲劳，有的可以出现恶心、呕吐、食欲下降等。
宝宝接种疫苗后出现不良反应后，应该针对不良反应进行治疗。如出现皮肤过敏的情况，需要通过口服抗过敏类的药物进行治疗。如果是出现皮肤发痒，可以局部涂抹止痒类的药膏进行治疗。
放射性的皮炎，放射性直肠炎，放射性膀胱炎，骨髓抑制等。现在出现发热的情况，有没有查血常规看看是否是骨髓抑制造成白细胞降低引起的。一旦出现白细胞偏低，及时给予升白细胞药物处理。
小儿腹泻、呕吐要停止使用辅食、不容易消化的食物。
同时，还需停止脂肪类食物，母乳喂养的孩子，适当减少胃部的次数和时间，可以口服补液盐，注意小儿腹泻、呕吐，暂时禁食6-12小时。禁食期间静脉输液，浮现呕吐好转后可以口服补液盐，逐步恢复母乳喂养，人工喂养婴儿可以先喝米汤、稀释牛奶，由少到多，由稀变稠，逐步过渡到正常饮食。小儿腹泻呕吐时大便次数多，严重脱水时会出现皮肤弹性减退、尿少或无尿的现象，此时应及时补充口服补液盐，促进肠胃吸收，减少呕吐和脱水，不能一次性全部服下，严重脱水者应立即送医院静脉输液。小儿腹泻呕吐可外用丁桂儿脐贴、思密达内服等微生态制剂，如妈咪爱、金双歧等，具有保护肠道正常菌群的作用。需前往医院儿科就诊，在医生的指导下用药。
