腰穿一般没什么后遗症，腰椎穿刺的术后并发症主要是低颅压性头痛，表现为坐起后有明显头痛，而平卧后头痛减轻或消失，这主要是由于部分患者手术后，仍有部分脑脊液从穿刺针口中外漏，造成颅内压力降低，牵拉神经，导致头痛，所以在做完腰椎穿刺术后，一般都嘱托患者卧床4到6小时，以预防低颅压性头痛的发生，此外即便发生了低颅压性头痛，一般持续4到6天后常可自愈。
腰穿可以检查脑部疾病的，腰穿术后需要去枕平卧四小时至六小时，视患儿情况而定，对惯于用枕者，在其头后放一薄枕三厘米至五厘米厚，使颈部肌肉松弛，腰背处也垫一薄枕，以防止穿刺后腰背不适。腰穿以后还需要动态监测体温、脉搏、呼吸、血压、意识、瞳孔、呕吐、头痛等情况，发现异常及时报告医生，以免发生意外。
腰椎穿刺术很安全，腰椎穿刺术后或者是腰椎麻醉术后，病人有时候会发生头痛，这是因为有时候脑脊液从穿刺孔中外渗，脑脊液的压力降低，牵张颅内的静脉窦，静脉记忆脑膜等组织而引起头痛。
患者侧卧位，腰背部消毒、铺无菌巾。向腰后部正中定好的腰椎间隙打局麻药。使用腰椎穿刺针从腰后部正中向前方慢慢刺入，经过腰后部的韧带进入椎管内。使用注射器抽取少量的脑脊液进行化验。如果需要药物治疗的情况下，再向穿刺针内打入药物。操作完毕后，撤出腰穿针，局部用棉球压迫。
患者侧卧位，腰背部消毒、铺无菌巾。向腰后部正中定好的腰椎间隙打局麻药。使用腰椎穿刺针从腰后部正中向前方慢慢刺入，经过腰后部的韧带进入椎管内。使用注射器抽取少量的脑脊液进行化验。如果需要药物治疗的情况下，再向穿刺针内打入药物。操作完毕后，撤出腰穿针，局部用棉球压迫。
