治疗的目的是维持生命机能，以防并发症尽量减轻，进一步出血。卧床休息，不要搬动，以免出血加重。要密切观察神志，瞳孔，呼吸血压脉搏的变化，保持呼吸道通畅，大便通畅，适时变换体位，防止褥疮和肺炎。
脑干出血患者的清醒时间主要取决于出血量的多少。如果出血量大约10ml，患者基本上没有清醒的可能性。因为在临床上脑干出血大于10ml，死亡率是接近100%。如果脑干出血量比较小，经过积极的保守治疗，比如脱水降颅压、清除氧自由基、护胃、营养神经等处理，一般在1周之内能够清醒。对于中等脑干出血的患者，早期经过积极的保守治疗，后期待病情稳定一般需要3周左右。
心里治疗，改善学校与家庭环境，消除诱因。确立诊断后即予暗示治疗，暗示治疗是癔症有效方法之一，也有助于诊断与鉴别诊断。平时应注意解除不良刺激因素，改善周围环境，帮助患儿培养健全的人格。
脑干出血昏迷是一种比较常见的临床症状，首先要做头部ct检查，确定脑干出血的位置和出血量，如果出现脑干出血出了脑室，必须立即进行手术，避免出现脑脊液循环堵塞，出现急性脑积水。
所以，在这种情况下，病人必须立即进行脑室外引流术。还要检查呼吸情况，脑干出血会影响呼吸的功能和呼吸节律，如果呼吸节律缓慢，或者是表浅，需要立即进行气管插管，同时使用呼吸机进行呼吸，保证基本的氧气供应。
脑干出血可能不会痊愈，具体分析如下：
脑干是人的生命和呼吸的中枢，很多重要的神经核团都集中在脑干里，所以当脑干内出血的时候，会出现意识障碍、呼吸困难、吞咽困难、出血量超过2ml的时候，会有生命危险，还会有中枢发热、高烧不退等症状。同时，脑出血后，患者的经常会出现肺部感染、应激性溃疡、脑心综合征、褥疮、低蛋白血症、肾功能衰竭等并发症。所以，脑干出血往往会留下无法治愈的副作用。
脑干出血恢复期的长短与脑干出血的数量和影响的程度有关，一般在3个月至6个月之间，还可能会留下比较明显的后遗症。因为脑干是中枢神经系统中最重要的器官，它涉及到人体的很多重要功能，特别是呼吸循环，所以脑干出血一般都会出现不同程度的昏迷，大部分患者会在两个星期内因为并发症而死亡。极少数患者在接受全面的治疗后，可以活下来，但是他们的身体会出现麻痹、肌肉紧张、生活质量降低、甚至是植物人的情况，需要长期的康复，可以通过高压氧、针灸、理疗、脊髓电刺激等方法来缓解。