柯萨奇病毒感染可以选择药物治疗。柯萨奇病毒是一种感染了人类呼吸道粘膜上皮和胃肠道粘膜上皮细胞中的一种疱疹病毒。柯萨奇病毒会导致咽喉疼痛、咳嗽、发热、疱疹性咽颊炎、腹泻、发热、恶心、呕吐。柯萨奇病毒目前还没有针对病毒的有效药物，因此不需要进行抗病毒治疗。如果出现发热症状，可以口服退热药物，避免出现心肌炎等严重的并发症。
柯萨奇病毒是一种肠病毒，主要分为A类和B类，主要经消化道，呼吸道传播，柯萨奇A型病毒感染主要表现为咳嗽，发热等上呼吸道感染症状，柯萨奇病毒B型感染，主要表现为胸胁痛。血清病毒分离可以明确诊断。
柯萨奇可发生鼻塞、咽炎、流涎等前驱症状，且常有疱疹性咽炎性发疹，可持续，在发热时或热退后出疹，为2-5毫米大小的斑疹或丘疹，主要分布于面部及躯干(但决不见于臀部)。此皮疹一段时间消退，但亦可演变为5-10毫米大小淡黄色不透明的水疱，成批发现于躯干，后向四肢蔓延，但不侵犯掌跖，不痒，需1-2周才消退，留有棕褐色色素沉着。
一般在1周内的时间都能够痊愈。如果病情比较重，时间可能稍微超过1周的时间。柯萨奇病毒可以分为A、B两组，两组的病毒总共有29个血清型，可以导致多种不同的疾病，其中临床比较常见的是手足口病。
柯萨奇病毒可以导致手足口病，也可以导致疱疹性咽峡炎。如果病人没有发热，咽峡炎没有导致咽痛、没有影响进食，手足部和其他部位的皮疹没有出现破溃感染，并且精神状态良好，可以不进行任何治疗。因为手足口病和疱疹性咽峡炎都是自限性的疾病，一个星期左右，这些症状都能够消退。
是需要有1-2周才可以治愈的，可使用一些抗病毒药物，采用酶联免疫法检测柯萨奇病毒混合型IgM.干扰素组在常规治疗的基础上加用干扰素注射液结果，可以改善症状的，忌食辛辣刺激性食品。
