首先是药物治疗，口服雌激素的药物进行治疗，用量要按照医生的嘱咐进行的，不能胡乱用药。女性体内的雌激素和孕激素主要由卵巢合成、分泌的，雌激素低会出现闭经的情况，还是比较严重的，所以可以通过多种方法治疗。
三个月没有来月经，到医院抽血化验，显示雌激素水平偏低的话，就会导致子宫内膜偏薄，引起闭经。是由于内分泌紊乱引起的。建议如果雌激素水平偏低，可以在医生的指导下吃些调理得药，补充体内的雌激素水平。也可以采取雌孕激素序贯疗法调理月经周期。
闭经前雌激素低调理方法包括：主要是补充含有雌激素的食物为主，如美味的豆浆，吃点家常豆腐及豆腐脑；植物雌激素广泛存在于豆类、谷类、水果、蔬菜等300多种植物中，日常饮食中除大豆及其制品外，小麦、黑米、扁豆、洋葱、苹果、石榴、银杏、茴香、葵花子、咖啡和橙汁等食物中含量相对较多。
有很多年轻女性雌激素偏低是为了苗条因为饮食不规律引起的，例如减肥等。雌激素分泌过低会导致月经不调、子宫变小，严重的会引起骨质疏松，停经，还回导致更年期症状，所以引起重视。保持心理健康，注意劳逸结合。要避免过度减肥、剧烈运动。因为过度减肥、长期剧烈运动。
治疗要明确是那种疾病再进行治疗，可以到正规医院内分泌科或外科就诊检查，根据病情采取激素类药物、手术、放疗等方法治疗。甲状腺-肾上腺皮质激素、性激素替代疗法，适用于全垂体功能衰退引起的多腺体功能减退者。垂体性闭经-手术和放射疗法垂体性闭经-食疗。