亚急性甲状腺炎可以通过西医的药物来进行治疗。此时要根据病人的情况选择合适的药物。如果是轻度的，可以缓解局部症状，也可以缓解甲状腺功能的异常。
常用的止痛药物是阿司匹林，也可以服用醋氨基酚、水杨酸盐等药物，对亚急性甲状腺炎有很好的控制作用。如果是比较严重的病人，出现了发热、疼痛等症状，可以使用口服阻滞剂普萘洛尔等非类固醇抗炎药。
也可以使用强的松等糖皮质激素，这是一种能够迅速减轻病人身体不适的药物。在治疗期间要注意观察病人的血沉变化，并在医生的指导下使用药物。
亚急性甲状腺炎有可能是自身免疫功能紊乱所致，也有可能是病毒感染所致，原因不同，方法不同。应该先注意做个甲功七项检查，血常规检查和甲状腺彩超检查来判断。如果是病毒感染所致，可以用消炎抗病毒药物治疗。如果是自身免疫性甲状腺炎，要考虑用糖皮质激素医治。
亚急性甲状腺炎症通常可以自愈。
亚甲炎是由于病毒感染所致的甲状腺炎症，临床上没有特别的治疗措施。远期预后良好，复发率极低，每年约2%的复发率。此外，亚急性甲状腺炎是一种自限性疾病，多数患者通常是可以自行痊愈的，但是在某些地方出现的肿胀和不适症状会持续几个月或更久。在康复过程中，需要对病人进行心理治疗，还要保证病人的情绪稳定，并建立起战胜疾病的信心。
亚急性甲状腺炎多导致内分泌系统变化，因此，治疗上以内分泌科居多，但有发烧或全身乏力症状，以及其他某些外科，亦可到普通外科就诊。
亚急性甲状腺炎是一种病毒感染性甲状腺炎症性病变，主要表现为甲状腺疼痛，可伴有发热、乏力、肌肉酸痛等，如果发现了有明显甲状腺肿大或者结节，就需要及时就医检查，以免延误病情而造成更严重的后果。对亚急性甲状腺炎病人来说，平常饮食要颇为讲究，勿食辛辣刺激性食物，也勿饮浓茶。
亚急性甲状腺炎血沉增高可能是患者患有亚急性甲状腺炎或是由病毒引起，具体分析如下。
亚急性甲状腺炎又称巨细胞性甲状腺炎，柯萨奇病毒和腺病毒是导致亚甲状腺炎的主要原因。典型的症状是甲状腺肿大、疼痛等，严重时会出现发热、头疼、乏力、口干等全身症状。主要表现为上呼吸道感染，病毒感染后1-3周。血沉快是甲状腺激素的特点，一般血沉在每小时50毫米以上。
亚急性甲状腺炎可能会影响怀孕。
亚急性甲状腺炎很可能影响妊娠，因此，想怀孕必须等亚急性甲状腺炎治好了。在妊娠期当中，对于一些没有症状或者是轻度的亚临床甲状腺炎患者，一般都不会对其身体造成明显的影响，因为病情相对较轻。还有少部分亚急性甲状腺炎，不能根治，就很可能留下永久性甲减，但若留下甲减，仅需补充甲状腺激素即可，使病人甲状腺功能在妊娠规定范围内，即可妊娠。
