支原体感染常伴有上呼吸道感染症状，如咽喉干痒、疼痛、咳嗽、体温一般在38度左右、出现饮食差、身体乏力、肌肉酸痛等症状，可以以持续性、阵发性呛咳为主，痰中可能带有血丝，伴有恶心、呕吐等消化道症状。
支原体感染和病毒感冒区别有临床症状方面不同。反复高烧是病毒性感冒的主要原因。有支原体感染的人会有下午发热的症状。此外，病毒性感冒还会出现咳嗽、咽喉红肿等症状。而支原体感染引起的咳嗽，一般是一种刺激性的干咳，夜间比较重。如果只是单纯的看病人的临床表现，是无法将病毒与支原体感染彻底区别开来的。如果有必要，可以根据血常规、支原体抗体等进行综合分析。
尿频、排尿刺痛、尿道口红肿、有少量粘液性分泌物是男性支原体感染的主要表现。男性支原体感染后，会出现尿道的炎症反应，这是由于支原体的宿主是尿道粘膜。支原体感染的典型临床症状是尿道发炎，小便刺痛，用手指挤压阴茎会有白色的分泌物渗出。男性支原体感染一般不会出现淋病的症状，尿路流出的分泌物为乳白色，淋病则是大量的黄色脓性分泌物。
支原体感染的症状主要与感染的严重程度以及感染的部位来判断，如果支原体感染呼吸道系统的时候，病人大多数出现咳嗽、痰少，也有一部分病人会出现胸痛、腹泻、以及胸闷的症状，如果是支原体感染导致泌尿系统出现尿路感染，可能会出现尿频、尿痛、以及尿急的情况，严重还会出现血尿，此时需要到医院进行相关检查，明确感染部位进行针对性治疗。
支原体感染肺炎的患者会出现肌肉酸痛、腹泻、乏力、咽痛、头疼、发热、咳嗽以及咳痰的症状。这种病的起病很慢，潜伏期多在两个礼拜到三个礼拜。患者的咳嗽症状主要为阵发性的刺激性干咳，不会有太多的痰液发热的时间会持续两个礼拜到三个礼拜。有些患者体温恢复以后，仍然会有咳嗽的症状，偶尔还会伴有胸骨疼痛。部分患者还会出现斑丘疹或者皮疹。
支原体感染了，患者可能会有发热、乏力、尿道口刺痛、尿频等症状。
支原体感染通常会引起呼吸道感染、泌尿生殖道感染，不同的感染情况，可能会导致患者出现不同的症状。比如呼吸道感染的患者可能会有发热、乏力、头痛、咳嗽、咽喉痛、肌肉痛等症状，而泌尿生殖道感染的患者可能有尿道口刺痛、尿频等症状。
