巨细胞病毒感染，可应用各种抗病毒制剂如GCV、抗巨细胞病毒的免疫球蛋白制剂、干扰素及转移因子等来治疗，在治疗之后也要注意预防。平时也要注意有意识的身体素质的锻炼，提高机体免疫力，预防病毒感染，要注意卫生环境，饮食环境，饮食方面建议以清淡营养为主。
其实巨细胞感染，听起来很可怕，但是这只是一种普通的病毒感染很多人在日常生活中都会感染到这种病毒，只是这种病毒的隐藏性比较深，如果及时发现可以得到有效的治疗将其清除，如果不能及时发现，这种病毒有可能自己消失也有可能成为许多疾病的发病原因，想要治疗这样的疾病，只要口服消炎药物就可以。
妊娠合并巨细胞病毒感染通常主要使用抗病毒药物治疗。
感染后建议去正规三甲医院就诊，在医生指导下使用对胎儿影响小的药物，一般最少需要治疗3-6个月，治疗期间定期复查指标，如果结果显示阳性要继续治疗。为防止用药影响胎儿发育，要做好产前检查，尤其16-20周的唐氏筛查和22-26周的四维彩超排畸检查，如果出现异常情况，根据医生建议终止妊娠。
注意均衡营养饮食，保持心情舒畅。
巨细胞病毒感染一般不需要进行治疗，需要密切观察。如果需要治疗，常见如下：
1.症状较重的病人，如果出现了神经系统症状、肺炎、肝炎等疾病，可以口服更昔洛韦、膦甲酸钠等药物。
2.抗病毒疗法：最好的治疗方法是更昔洛韦，但是它的生物利用度很低，需要静脉注射。缬更昔洛韦是缬氨酸更昔洛韦的先驱物，其口服后的生物利用度得到了极大的提升，具有很好的抗病毒效果。
3.对于患者治疗不建议采用预防性的方法，但必须严密监控，一旦CMV-DNA阳性，缬更昔洛韦可尽早进行预防性治疗，以减少患者的感染。
新生儿巨细胞病毒感染主要是孕妇产前感染、产后新生儿直接感染巨细胞病毒。还有可能通过哺乳引起传染的。宝贝患有该病，临床可以出现气促、肝脾肿大、刺激样咳嗽等症状，巨细胞病毒存在于宿主咽部、唾液腺、子宫颈、阴道分泌物、尿液、精液、乳汁及血液中，可造成胎儿先天性感染、围生期感染以及出生后早期感染。
当宝宝感染巨细胞病毒后引起各脏器损伤而出现的一系列症状，称为巨细胞病毒感染。临床表现有不同程度的发热，给予抗细菌治疗无效，宝宝常有恶心，呕吐，厌食，烦躁不安，消瘦等症状，巨细胞病毒可引起肝损伤，不同层度的黄疸，谷丙转氨酶升高，还可引起肺炎，心肌炎，胃肠炎，可损伤听觉，神经等，甚至损伤机体的免疫机能。