先天性幽门狭窄手术费用需要1万-3万左右，幽门狭窄是一种先天性消化道疾病，最常用的治疗方法就是手术治疗，收取手术费用是根据医院所在的地区以及医院的等级而定的。在一线城市幽门狭窄手术花费手术金额会更高。
先天性幽门狭窄可通过以下几种途径进行治疗：
第1种，手术治疗。手术切除对先天性幽门狭窄的疗效最好，应用也最为广泛。可进行幽门肌切开术。又因为先天性幽门狭窄属先天性消化道畸形。用药达不到疗效。
第2种，可通过日常饮食调节的方法治疗。但因此种疗法治疗过程较长，且疗效不如手术治疗好，故不是优先选择的方法。
一般情况下，先天性幽门狭窄，患者可以通过手术治疗的方式进行改善，具体情况分析如下：
先天性肥大性幽门狭窄是一种器质性疾病，是一种不能用其他方法来治疗的器质性疾病，早期采用开腹手术，现在采用腹腔镜切除孩子的环状肌肉，对孩子的影响不大。此外，还可以通过儿童胃镜进入胃腔，在不损害儿童幽门周边粘膜的情况下，利用粘膜下隧道切开幽门肥厚环形肌。
先天性幽门狭窄可能是以下原因引起的。
先天性幽门螺杆菌感染是一种较为普遍的先天性幽门螺杆菌感染，其病因不明，主要与下列因素相关：
1、发育期间出现的幽门环状肌肉肥大；
2、感染病毒；
3、患者出生后，由于内分泌荷尔蒙的改变，引起了局部的环状肌肉增粗；此类儿童在出生后2~3个星期内会表现为恶心呕吐、进食后呕吐，呕吐中没有胆汁。
幽门狭窄手术一般这样做：
对于幽门狭窄的患者，如为良性的狭窄，或是12指肠球部溃疡所致的疤痕性狭窄，则可以通过气囊进行扩张。若有较大的狭窄，则行内窥镜下esd，即黏膜下的固有肌剥离，亦即松解。对于严重的幽入口下狭窄，以上所说的方法都是无效的，可以考虑通过外科的方式进行局部切除，同时行12指肠切开和吻合器。
幽门狭窄的手术，可以做微创的，也可以做普通的。具体情况要看引起幽门狭窄的病因。临床上导致幽门狭窄的疾病有良性的，也有恶性的。
良性幽门狭窄的手术方式可以采用胃大部切除术，切除狭窄的幽门及胃窦组织，再做胃肠重建。恶性幽门梗阻需要做根治性胃癌切除。
在做手术前，应该少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。