转移因子胶囊其副作用较少，常见的有：局部有酸胀感、个别出现皮疹、皮肤瘙痒、痤疮增多及一过性发热等反应，一般停用后逐渐好转。长期口服具有以上反应症状，可以停用。
复可托常用于呼吸道感染，支气管炎，肺炎，哮喘，重症带状疱疹及牛皮癣的治疗，亦可用于恶性肿瘤病人放、化疗及术后生活质量，降低各种原因引起的感冒，发烧和其他感染的发生率。
一般来说，小孩太过频繁细菌感染可以吃转移因子。具体分析如下：
如果小孩太过频繁细菌感染，可以通过给予转移因子来缓解。因为转移因子属于小分子的物体，不被胃酸所破坏，能够调节孩子的免疫力，降低孩子细菌的感染几率。家长应该让患儿多吃含钙丰富的食物，如猪骨、猪蹄等，注意患儿的饮食清洁卫生，不吃腐败变质食品，注意休息，适当运动，保持环境安静和室内空气新鲜。
转移因子是一种生物制剂，一般没有明显的副作用，但是也不排除特殊情况，比如：个别出现皮疹、皮肤瘙痒、痤疮增多及一过性发热等反应。不能长期服用，长期口服转移因子会抵制自身的免疫系统。
转移因子胶囊具有免疫活性较强，起效快增强机体免疫力。不能长期服用会影响自身抵抗力。要从饮食上提高自身免疫力，不要着凉防止感冒，以免加重肾病综合症。低盐清淡饮食。
转移因子口服液本品用于某些抗生素难以控制的病毒性或霉菌性细胞内感染的辅助治疗（如带状疱疹、流行性乙型脑炎、白色念珠菌感染、病毒性心肌炎，小儿轮状病毒性肠炎等）;亦可作为恶性肿瘤的辅助治疗剂;本品可用于湿疹、血小板减少、多次感染综合症。