一般情况下，停经40天B超未见孕囊是否正常，要根据具体情况进行分析，可能是正常的，也可能不正常。具体内容如下：
1.正常：如果女性体内，精子和卵子结合的时间比较晚，受精卵进入子宫内生长并发育的时间也较晚，停经40天时B超未见孕囊是比较正常的，不用过于担心，建议停经7周左右再复查超声。
2.不正常：停经40天B超未见孕囊也存在不正常的可能，也许是女性并未成功怀孕，或者出现了异位妊娠的情况，建议女性及时就医检查，以免影响身体健康。
一般来说，停经40天b超看不到孕囊的主要原因是以下这些：
1、月经不正常、受孕晚，有的女人月经不规律，一般要40多天才来一次，这个时候，即使检测出来了，受孕的时间也比较晚，在子宫里见到孕囊的时间也比较晚。
2、可能是因为子宫外孕，也可能是因为妇科的炎症，比如输卵管炎。B超检查没有发现孕囊，有阴道出血、腹痛等症状患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。
停经九天要注意怀孕的可能性较大，首先用试纸或空腹抽血化验一下hcg，另外考虑是月经不调，或要排除有无尿路感染的存在，可通过中药进行调理，平时多喝水，忌食辛辣刺激性的食物，避免劳累。
停经40天，怀孕天数在6周左右的，建议做好孕期保健工作。同时建议注意休息，少食生冷刺激性食物，考虑怀孕的前后3个月禁止性生活，防止导致流产的可能较好的，同时注意加强孕期营养，定期到医院检查胎儿的情况。
怀孕40天孕酮正常为24.5-7.6ng/ml，如果孕酮数值相对比较低，就有可能会影响到胎儿的健康发育的。这种就需要采取孕激素的药物对症治疗的，临床上常用的是黄体酮来进行对症治疗，同时多注意休息，定期复查。