扁平苔藓一般较难彻底治疗的，局部治疗主要是针对有疼痛症状的充血和糜烂病损，全身性治疗包括糖皮质激素、免疫制剂等，药物副作用较大，需结合症状及时减量或停用。扁平苔藓是一种较为常见的慢性皮肤黏膜疾病，与真菌感染的“癣”是不一样的，没有传染性。发病病因还不是太清楚，研究表明可能与精神因素、免疫因素、内分泌因素、感染因素、以及某些全身疾病有关。
扁平苔藓可以通过电子显微镜和病理切片发现可疑的病毒和细菌，一般高黏血症与再生循环障碍与扁平苔藓有很大的关系，平时要注意保持愉悦的身心，不要有太大的压力，生活作息要规律，可考虑中西医结合治疗。
扁平苔藓，其原因目前尚不清楚，可能是遗传性过敏，也可能与炎症病毒等资质有关。他主要引起红斑、外观、脱皮、水泡、红条纹、严重瘙痒、色素沉积和皮肤斑点。病灶局限范围较小者可用冷冻激光或同位素治疗。
扁平苔藓是一种不明原因引起的累及皮肤、毛囊、甲、黏膜的慢性炎症性疾病，治疗扁平苔藓要到专业的口腔黏膜科，治疗扁平苔藓要利用自身免疫系统与本病的密切关系，且各脏腑经络病变的相互传变，对扁平苔藓进行辩证论治。采用中西医结合免疫平衡治疗体系，将中医中药治疗跟口腔治疗仪物理治疗相结合，有效治疗扁平苔藓积极的治疗是可以治的，不必担心。
部分口腔扁平苔藓的患者会出现自愈。这一部分的患者，多半是病变比较轻微的，没有明显充血的患者，没有明显糜烂的患者，没有明显自觉症状的患者。而且这种病变多是由于心理因素造成的，比如患者有精神创伤史，有下岗失业，有亲属亡故，有婚恋纠纷等。