针对肺炎支原体的治疗，首先需要给患者做痰液培养加药敏试验，选择药物进行对症处理，一般效果会比较理想，病程也会明显缩短。临床上一般多选择的治疗支原体药物有大环内酯类药物，一般在肺炎早期病情比较重，都是给予阿奇霉素注射液静脉点滴三天，三天后如果症状明显减轻，可以改用口服，阿奇霉素在治疗时一定要遵循一个原则是用3天停4天，7天为1个疗程，一般需要3-4周系统有效的治疗可以将肺炎支原体治愈。
肺炎支原体抗体大多数易因为支原体感染所导致的呼吸道疾病，其主要的症状和细菌性肺炎有相同之处，例如头痛、咳嗽、发烧以及吐痰，可能持续的时间较长，肺炎支原体抗体的检查能够快速的诊断肺炎的致病菌，如果检查的时候呈阳性大多数已经确诊为肺炎支原体感染所引起的，需要在医生的指导下，选择适合的抗生素药物来控制感染。
支原体抗体阳性，不能够完全确诊患有肺炎，还需要结合患者的症状和体征以及身体的其他肺部影像学检查来共同确诊，肺炎支原体抗体阳性只能说明患者携带肺炎支原体，近期感染过肺炎支原体，需要到医院通过进一步的确诊，直接检测肺炎支原体抗原，这种诊断方式适用于早期快速诊断的结果，所以肺炎支原体抗体阳性，只能够说明有肺炎的可能性。
肺炎支原体衣原体可以使用抗生素。
如肺炎衣原体感染，可使用大环内酯类抗生素，例如罗红霉素和阿奇霉素，也可给予四环素类抗生素，如米诺环素。另外，还要注意患者是否合并其他疾病，例如糖尿病，同时需对症处理，如有热等情况，然后服布洛芬。
但是以上药物都需要在医生的指导下使用，以免用药不当，损害身体。
肺炎支原体抗体阳性，说明已经受到了支原体的感染并引发了支原体肺炎。这是人体呼吸道疾病当中的常见类型，患者要及时服用抗生素类的药物，以及消炎杀菌抗感染之类的药物治疗，控制病情的不断加重，较为常用的有左氧氟沙星、阿奇霉素、阿莫西林、环丙沙星、克拉霉素等等。如果病情较为严重，也可以通过雾化等方法同步治疗，以便促进病情更快恢复。
多数人不经治疗可自愈。大环内酯类抗生药物。是肺炎支原体肺炎的首选药物。疗程2周左右。后期如有会合并细菌感染，可根据病情及细菌培养结果选药。抗体阳性可持续3-6个月才会自然转阴。因此不应针对抗体阳性选择治疗。
