在胚胎期肺芽发育过程中出现异常的分支，其远端形成上皮细胞巢，再逐渐分化而形成囊肿，囊肿的管腔呈条索状，与支气管不通或仅有部分沟通，另—种解释认为肺囊肿的形成是在先天性肺不张的基础上，使胚胎期正常的肺结构和上皮细胞的排列发生紊乱而造成。
如果确诊为双肺多发先天性肺囊肿，主要是要预防感冒，平时多加注意保养，再加以适当对症和抗感染治疗。同时也要在平时日常生活中，注意饮食习惯，保持营养均衡，保持健康的体质，提高自身体质的免疫力。
肺囊肿是可以治好的，肺囊肿引起的感染、咳血以及别的问题可以通过手术的方法将肺囊肿切除，达到治疗的目的。已有感染的应在控制感染中毒症状后手术，手术治疗比较的彻底。
为避免各种并发症，建议手术切除，但也有人认为如果没有临床不舒服，也可以观察，具体的治疗还是要到医院进行检查确诊。肺囊肿又叫先天性支气管肺囊肿，多见于男性的儿童和青少年，它的特点是远端支气管的先天性畸形，可以分为单发性或者是多发性。X线表现通常为单个或多个圆形、薄壁阴影，边缘比较清晰。如果囊肿和支气管相通，就会出现液气平面。
肺囊肿是胚胎发育障碍引起的先天性疾病，主要是由于胚胎发育时期肺芽逐渐发展形成支气管树和肺泡，肺芽在发育初期是索条状的组织，逐步演变成管状。如果胚胎发育发生障碍，索条状结构不能演变成管状。
可以通过口服抗炎药物跟通过手术来进行治疗，肺囊肿主要包括有先天性的和后天性的。先天性是由于胚胎发育不良引起的肺大泡。而后天性是由于各种原因引起的肺气肿破裂，融合成新的肺大泡。一般囊肿破裂之前，要注意保护肺内的正常的肺功能、恒定的压力。
