婴儿水样腹泻被认为是由消化不良或腹部感冒引起的。治疗消化不良的药物可用于治疗。此外，还要注意妈妈的饮食。选择易消化的食物，而不是生冷的食物。增加营养有助于调节婴儿的状况。多喝水。防止脱水。
一般情况下，腹泻拉水样且大便喷射状可能为急性肠炎等疾病。具体分析如下：
通常来讲，急性肠炎大多数都是由于细菌感染引起的，需要检查大便常规来确定。确诊后，患者可以口服诺氟沙星、左氧氟沙星等药物。此病须对症处理；如果出现严重的腹泻症状，要及时补充水分，以免出现电解质失调导致的脱水。需要注意的是，所有药物要在医生指导下服用。
腹泻时其大便性状发生改变，其中水样便较为常见，可由病毒或产毒性细菌感染导致。若婴儿腹泻呈水样便，常见轮状病毒、诺如病毒影响肠道黏膜对水分及电解质的吸收，肠液积聚，进而导致腹泻水样便。
拉水样便不一定是小儿秋季腹泻，可能是细菌感染导致的。
肺侵袭性的细菌有脓状病毒感染，其导致的腹泻主要在秋冬季节，因此叫做作秋季腹泻，6-24个月的婴幼儿常见。4岁后较少见，潜伏期1-3天，发病急伴有发热或上呼吸道感染，没有明显感染中毒的症状。发病的一两天内常可能腹泻、呕吐、大便次数多、水分多、量多，呈现黄色水样或蛋花汤样，还可能有少量的黏液，每一辛臭味，会导致严重的脱水酸中毒、电解质紊乱。秋季腹泻通常是自限性的，几天后呕吐慢慢消失，腹泻缓解，不再喂乳类的患儿会恢复更快，自然病程一般3-8天。
考虑肠胃炎导致的，不排除饮食以及受凉的原因，积极的进行治疗，避免脱水的现象，一定要适当多喝一些热水，注意腹部保暖，局部热敷，口服一些肠炎宁进行治疗，必要时口服补液盐，并注意观察体温变化，必要时进一步治疗。
