孟鲁司特上市使用后有以下不良反应报告，夜梦异常和幻觉、嗜睡、兴奋、激惹、包括攻击性行为，烦躁不安、失眠、感觉异常/触觉障碍及较罕见的癫痫发作、恶心、呕吐、消化不良、腹泻、ALT和AST升高，罕见的胆汁淤积性肝炎，关节痛，包括肌肉痉挛的肌痛；出血倾向增加，挫伤，心悸和水肿。
本药物副作用较为严重，可表现为胃肠道反应，患者服用后会出现腹部不适、腹泻、便秘等临床表现，部分患者还会出现身体乏力、头痛、性欲减退、阳痿等症状。患有胆结石、肝肾功能不全的患者不宜服用，可以加重胆囊疾病的症状，引起转移酶升高等症状。
非诺贝特副作用如下，腹部不适、腹泻、便秘。神经系统不良反应包括乏力、头痛、性欲丧失、阳萎、眩晕以及失眠。引起肌炎、肌病和横纹肌溶解综合征，导致血肌酸磷酸激酶升高。有使胆结石增加的趋势，也可能引起胆囊疾病，严重者需要手术治疗。
长期吃副作用大，在临床发现在高剂量连续使用羟考酮后，突然中断或减量，部分病人有戒断综合征的发生。表现为：兴奋、失眠、流泪、流涕、出汗、震颤、呕吐、腹泻，甚至虚脱、意识丧失等。这种症状可以逐渐减量最后慢慢停药减少戒断症状。
盐酸氨溴索口服溶液适用于急慢性呼吸道疾病，比如急慢性支气管炎、支气管哮喘、支气管扩张、肺结核等引起的痰液粘稠，咳痰困难的患者。该用临床应用多年，安全性比较好，不良反应轻微。偶可见皮疹、皮肤瘙痒、恶心、呕吐、胃部不适、食欲缺乏、腹痛、腹泻等，但是一般比较轻微，无需特殊处理即可消失。