目前还没有治疗肾囊肿的药物。对于肾囊肿的处理，主要是根据囊肿大小、部位以及是否合并感染或者破裂等情况做出决断。囊肿＜五厘米，而且没有不适临床症状，可以定期观察，不用处理。
如果是生理性的卵巢囊肿，不吃药也能够消除。如果是子宫内膜异位到卵巢上，形成的卵巢巧克力囊肿，或者是体内雌孕激素刺激而引起的普通囊肿，都没办法通过吃药将其消除。通常都只有等到囊肿大于五公分以上，行腹腔镜手术来进行治疗。
宫颈囊肿属于慢性宫颈炎的一种。是由于长期慢性炎症刺激引起的宫颈腺管堵塞。建议如果现在宫颈囊肿比较小的话，可以暂时观察。如果宫颈囊肿比较大的话，就需要做宫颈囊肿剔除术。术后注意外阴卫生，一个月内禁止同房。
口服药物没有效果，不要盲目服用药物。出现囊肿一般需要采取手术治疗，可以到正规医院外科就诊检查治疗。手术后要注意休息，注意卫生，按时换药，可以根据伤口情况采取消炎药等药物治疗，具体治疗可以遵医嘱进行。
这是粘液腺囊肿的表现粘液囊肿又称粘液腺囊肿在口腔粘膜下组织内分布着数以百计能分泌无色粘液的小涎腺称为粘液腺以下唇、软腭、舌尖腹面分布最多其排泄管开口于口腔内由于排泄管受到创伤粘液外漏而形成囊肿。多次复发或有瘢痕粘连的囊肿可行切除术；亦可考虑采用硬化剂注射冷冻或激光治疗，药物无效。
不管中药还是西药肾囊肿靠药物是无法治疗的，由于单纯性肾囊肿多无症状，对肾功能和周围组织影响不大，因此不需治疗，只要6个月到1年随诊。囊肿直径较大，超过5cm或产生周围组织压迫症状，引起尿路梗阻，则需要行囊液抽吸术并囊内注射硬化剂。