生理性卵巢囊肿包括卵巢潴留囊肿、黄体妊娠囊肿。生理性囊肿一般初次发现，病程短，一般月经干净后复查彩超可以消失。病理性卵巢囊肿一般病程持续半年以上，做彩超可疑卵巢子宫内膜异位囊肿，或卵巢畸胎瘤或交界性肿瘤或卵巢癌，一般需要手术治疗。
巢囊肿一般是内分泌失调引起的，属于良性病变，生长缓慢，如果小于6个厘米，可以先观察，暂时不用手术治疗。建议平时养成良好的生活习惯，适当锻炼，增强体质，肥胖，适当减肥，过度肥胖对卵巢功能是有影响的。保持良好的心情，不要过度紧张。
对良性、非赘生性、囊肿的直径大小在5厘米以内，又无任何症状的卵巢囊肿，不必作特殊处理，大部分可被机体吸收，自然消失。如果囊肿的大小超过5厘米，定期观察时有发展趋势，或囊肿发展快、增大明显，则应入院手术治疗。手术为卵巢囊肿切除术，输卵管卵巢切除术，附件及全子宫切除。
绝经这么久，卵巢分泌激素的功能已近消失。基本不再有促进乱巢囊肿生长的作用。所以不建议做手术，定期复查，如果发现卵巢囊肿长径超过5cm就需要手术治疗。平时低脂饮食，尽量不吃油腻厚味食物及辛辣刺激食物，适当进行体育锻炼。
卵巢囊肿是临床上比较常见的妇科良性肿瘤，如果体积小于4.0cm以下可以服用中成药活血化瘀治疗，同时结合微波局部理疗促进炎症吸收，治疗一个疗程以上再次b超复查看看。治疗期间不能同房，适当休息，不能剧烈活动。
考虑到胎儿的安全，妊娠合并卵巢囊肿一般不特殊处理，定期观察，监测囊肿的变化。卵巢囊肿对妊娠没有太大的影响。但怀孕期间卵巢囊肿有可能会因为激素水平变化而变大，直径5-7公分左右的囊肿，称为中等大小囊肿，中等大小囊肿有一定的重量，在剧烈运动时可能扭转，坏死甚至感染，可引起急腹症，需进行紧急处理。
