如果不是很复杂的肛瘘，通过手术就可以恢复。另外外用消肿止痛的中草药进行日坐浴。局部涂抹抗生素软膏。如果急性期可以口服抗生素，对症处理，不要超过一个星期。如果比较复杂，内口不确切的肛瘘有可能会复发，要清淡饮食，不要过多食用辛辣油腻上火的食物，注意局部的卫生。
挂肛肠科。选择肛肠科来进行诊断治疗，如果医院级别不够，或者是医院分科没有那么的具体和细化，可以直接去普外科进行诊断治疗。平时多饮水，禁忌辛辣刺激以及油腻的食物。
肛瘘一般两周可以痊愈，术后遵医嘱每日换药一次，注意观察伤口情况，便后坐浴，直至伤口完全愈合。出现皮肤瘙痒时，避免用指甲抓挠。保持大便通畅，养成定时排便习惯。保持肛周清洁卫生，勤沐浴、勤换内裤，每日睡前或便后温水坐浴。适当参加体育锻炼，如散步、打太极拳等，避免久坐、久站。
去医院到外科。要有肛肠外科。就挂肛肠科门诊检查治疗。肛瘘一般只能手术治疗才能治好，多吃蔬菜水果清淡的食物，多喝汤水，比如大白菜鸡蛋平菇汤等蔬菜汤，如果是暖和的天可以喝点酸奶调节肠胃、比如冰糖炖梨水。
肉眼检查：可见肛周皮肤有一个或多个瘘口，外口可有外突的肉芽组织，浅表肛瘘在内外口之间可摸到条索状物，挤压有脓性物排出；探针检查：由皮肤瘘口伸入探针，可与肛诊的手指接触，确定内口的位置；染色检查：经瘘口注入美蓝，预置于肛门内的纱布染蓝，以确定内口的位置；瘘口碘油选影：了解瘘管的走向与范围；纤维结肠镜检：对因克隆病、溃疡性结肠炎所致的瘘管，有诊断意义；病理诊断：排除某些瘘或瘘管恶性变。
