骨软骨瘤目前无相应的药物降低其发生率，主要以手术治疗为主，手术切除软骨瘤周围软骨帽，软骨瘤的基底部和相应骨膜部分，术后复发率较低。其恶变概率约为1%，但是多发性软骨瘤恶变率相对较高，恶性表现为生长迅速的软组织包块或顶部呈菜花状的软骨瘤，合并恶变率会增大。基底部宽的软骨瘤也存在恶变倾向，此类型病变，积极手术。
对于软骨瘤通常采用手术治疗。对于内生软骨瘤，可以采用病灶刮除植骨术；多发性内生软骨瘤因恶变的机会较大，一旦发生恶变就要进行截肢手术。对于因为关节磨损而出现的骨碎屑，或者伴有疼痛，可以采用理疗治疗.因为骨软骨瘤是一种良性的肿瘤，所以良性肿瘤治疗大部分就是手术切除。
有可能是属于局部损伤之后而引起的软骨瘤，也有可能是由于遗传基因引起，通常这个软骨瘤是属于良性的肿瘤，直接通过手术切除就可以，多发性骨软骨瘤病的存在并不一定需要做切除术.只有在局部发生疼痛，或产生压迫症状时，才可考虑切除有症状或引起症状的骨疣.手术方法同孤立性骨软骨瘤.切除时必须将覆盖其上的骨膜一并切除，否则容易复发。
手术时期是发现软骨瘤后局部引起疼痛症状，软骨瘤在早期发现治疗是最合适的，要根据自己的情况选择手术的方法。软骨瘤在临床上是比较常见的良性肿瘤，软骨瘤，单发比较多见，多见于下肢，膝盖周围及上肢的肘部内侧，这种良性肿瘤，最主要办法通过手术治疗，治疗率比较高，极少数也有病变的，另外就是大多数的单发骨软骨瘤病例，不需要手术切除，可以进行正常的工作和生活，当单发骨软骨瘤位于躯干时，即使无症状也需要切除。
软骨瘤是一种较轻微的良性肿瘤，且恶变概率很低，是相对较轻的疾病。但对于多发性的，尤其是儿童型的则要慎重，因为可能引起患儿四肢畸形。对于成年人，只需要定期观察。
骨瘤分为内生软骨瘤和外生软骨瘤。内生软骨瘤一般无临床表现时常不需要手术治疗，内生软骨瘤在受外伤之后会迅速膨胀生长，导致骨质的破坏与肢体远端的坏死，常需要刮除植骨内固定手术治疗。
