一般情况下，先天性宫颈闭锁的治疗方式主要为手术治疗，术后常需予药物治疗。具体如下：
一、药物治疗
1、头孢西丁钠：该药物主要用于术后预防感染，对头孢西丁及其它头孢菌素类药过敏的患者禁用。孕妇及哺乳期妇女、早产儿、新生儿慎用。另外，严重肝、肾功能不全患者慎用，胃肠道疾病，尤其是结肠炎病史的患者也需要慎用。
2、甲硝唑：与头孢西丁钠联合用药，为经阴道手术的常用抗生素，可以用于术后预防感染。但是妊娠期妇女及哺乳期妇女禁用。
二、手术治疗
1、子宫颈成形术：该手术主要适用于Ⅰ型或Ⅳ型患者。Ⅰ型子宫颈闭锁主要是因为闭锁的子宫峡部呈积血膨大的囊腔，囊壁为厚约6mm的肌性组织。术后患者不需要宫腔置管来防止粘连，如无盆腔严重合并症的患者，可保留生理生殖功能，经会阴途径行子宫颈成形术。Ⅳ型患者主要是因为该类患者无子宫峡部，孕期不能形成子宫下段而致不育。术后须子宫颈管内置管至子宫颈外口创面全部上皮化，日后注意避孕。
2、子宫切除术：适用于Ⅱ、Ⅲ型患者，因闭锁段子宫颈较长而且韧性大，很难打通，即使打通也会再闭锁，因此应切除子宫，待婚前再行阴道成形术。另外，患者子宫体下端口敞开无子宫颈黏液栓，出现子宫腔感染后，还需要要切除子宫。
患有肛门闭锁术应该及时通过服用促进胃肠道蠕动的药物，排出体内毒素，同时定期去医院进行清理人工造的瘘道，预防出现继发细菌感染等并发症。适当的进行一些运动，也可以促进胃肠道蠕动，促进这些代谢产物排出体外。
这种病是孩子在胎儿时期直肠发生了发育异常的情况而导致的，一般可采用手术治疗。如腹会阴肛门成形术：在会阴部、腹部做切口，将直肠游离，从盆腔至会阴做条隧道，将直肠穿出，与会阴皮肤吻合。
根据类型选择不同的手术方法。如肛膜切开术：于会阴肛区凹陷处取前后纵切口十字切口切开肛膜，使肛门内外相通。然后扩肛至能放入示指即可。或是腹会阴肛门成形术，尾路肛门成形术等。
治肛门闭锁的费用是1万-3万元。治疗多少钱不是一个具体数字能确定的，是根据患者病情轻来选择适合的手术，所以费用是不一定的。一般可采用腹会阴肛门成形术，尾路肛门成形术，腹腔镜肛门成形术等。
尿道缺如及先天性尿道闭锁危害是很大的，需要到泌尿外科就诊，通过手术治疗，手术后要注意个人卫生，勤换内裤，平时不能吃辛辣刺激的食物，清淡饮食。养成多喝水的好习惯，每天保持引流量在2000ml以上。
