发现时应及时去检查，若结石只是卡在隐窝部位，则可以选择用镊子取出即可，也有一部分与隐窝表面紧紧地结合在一起，这时可选用一些相关的器械进行操作，操作时动作要轻，避免损伤扁桃体。
小孩做扁桃体手术，其利弊要根据是否影响小孩发育情况来判断。
通常扁桃体在15岁前有能正常杀菌、抗炎，应尽量选择保守治疗，不建议首选手术治疗。若扁桃体反复发炎，如在1年内反复3次发炎，伴有化脓性扁桃体炎，扁桃体附近脓肿，睡觉有时打鼾、憋气的情况，此时建议进行手术治疗。扁桃体反复发炎，会导致心肌炎、肾炎等相发症，有这些症状时建议手术治疗。
扁桃体结石不严重，解决办法是要适当采用一些含化药物，结石的原因也可能与反复感染有关系。如果是经过一般处理和含化药物处理，效果不好，要及时到耳鼻喉科就诊。
如果发烧不超过38。5度，需要3到7天左右就会好，如果发热总是反复，复发超过38。5度，输液治疗，效果会来的更快点，输液通常需要3天左右就可以痊愈了，一定要注意给宝宝做好保暖。
扁桃体结石分为保守治疗和手术治疗，对于一些较顽固的扁桃体结石不应该用保守治疗，可以考虑进行扁桃体切除手术，以消除口臭以及咽部不适。保守治疗有时不能将已有的结石完全消除，存在复发的几率，直接进行扁桃体切除手术可以使扁桃体结石治好。
