肛瘘是需要医治，不治是不会自己好的，一般可以通过手术医治，在饮食方面要清淡，主要吃流食和易消化食物、可以多吃青菜和水果，平时还要注意局部卫生，多用清水清洗，还要多注意休息。
肛瘘的治疗方法就一个就是手术，但手术的方法很多，因为肛瘘有简单的、有复杂的、有高位的、有低位的，所以手术方法有很多。有肛瘘切开术、肛瘘切除术、肛瘘挂线术、肛瘘切开挂线术，还有些新的方法，比方说肛瘘修补、瘘管切除，还有好多新的方法，比方说有胶粘，有利普刀的手术、肛瘘镜等。但是最基本的方法，就是把低位的肛瘘切开，高位的挂线。
肛瘘的治疗方法就一个就是手术，但手术的方法很多，因为肛瘘有简单的、有复杂的、有高位的、有低位的，所以手术方法有很多。有肛瘘切开术、肛瘘切除术、肛瘘挂线术、肛瘘切开挂线术，还有些新的方法，比方说肛瘘修补、瘘管切除，还有好多新的方法，比方说有胶粘，有利普刀的手术、肛瘘镜等。但是最基本的方法，就是把低位的肛瘘切开，高位的挂线。
肛瘘是不能针灸治疗的。肛瘘是由于肛周脓肿造成的窦道，由于与外界相通，大便时会有粪便进入窦道，长期感染，经久不愈，是一种器质性病变。可以在痿官内塞药纸进行治疗。
肛瘘临床治疗方法可用药物治疗，肛瘘有间歇期和发作期。间歇期会完全没有症状，这时可以不用药。发作期出现流脓、红肿、疼痛等症状，如果不能马上手术，也可以采取药物治疗暂时缓解症状。
肛瘘不能自愈。不治疗会反复发作直肠肛管周围脓肿．因此必须手术治疗。手术原则是将瘘管全部切开，并将切口两侧边缘的瘢痕组织充分切除，使引流通畅，切口逐渐愈合。对于距肛门3-5cm内，有内外口低位或高位单纯性肛瘘可以采取挂线疗法，改制了方法也可以作为复杂性肛瘘切开、切除的辅助治疗手段。此外必要的抗炎药物治疗也很重要。
