便秘与腹泻交替，便中含有粘液及血丝，大便时肛门口灼痛。因分泌物刺激，肛门周围表皮脱落，有时成裂口发痒，下腹部胀满不适，食欲不振，体重减轻，全身不适。直肠出血或直肠排出粘液，由单纯疱疹或巨细胞病毒引起的直肠炎，这种直肠炎的症状可伴有强烈的肛门直肠疼痛。
轻症腹胀、消瘦、乏力、肠鸣、失眠、多梦、怕冷，严重者有可发热，心跳加速，以及衰弱，贫血，失水，电解质平衡推敲和营养障碍。重者鲜血下流，以至休克、癌变。急性期的症状迁延不愈或直至放疗结束6个月至数年后始有显著症状者，均提示病变延续，终将发展引起纤维化或狭窄。此期内的症状，早的可在放疗后半年，晚的可在10年后甚至30年后才发生，多与肠壁血管炎以及扣续病变有关。
肛门下坠感、腹泻、里急后重；血便、黏液便或黏液血便。直肠炎轻者仅黏膜发炎，重者炎症累及黏膜下层、肌层，甚至直肠周围组织；有时只是部分直肠受累，有时直肠全部甚或累及肛门。
常见的直肠炎主要表现为肛门下坠感，腹泻，里急后重，点血粘液便或黏血便。由于病因的不同临床表现也不相同，直肠出血，或者直肠排出粘液，粘液血便，有淋病、单纯疱疹和巨细胞病毒引起的直肠炎，可伴有强烈的肛门直肠疼痛。
肛门直肠疼痛，由淋病、单纯疱疹或巨细胞病毒引起的直肠炎可伴有强烈的肛门直肠疼痛。腹痛，便秘、腹泻或便秘与腹泻交替，伴有全身症状或消化道其他部位疾病人可出现相关症状，如发热、食欲不振、恶心呕吐、消瘦、肛门灼痛、排便下坠、里急后重等。