小儿疝气是先天性的，它是因为先天性的解剖结构鞘状突在出生以后没有闭塞，在腹股沟区遗留一个通道。
在腹压增加的诱发因素下，腹腔内、盆腔内的脏器比如说肠管、卵巢、子宫等通过这个通道由腹腔或者盆腔下降到腹股沟区或者阴囊内，形成一个质软的、可回纳的包块。小儿疝气往往不能自行愈合。保守治疗没有明显的效果，需要手术治疗。
隐睾是一种先天性发育畸形的疾病，是由于双侧或单侧睾丸没有下降到阴囊，所以睾丸也下降不全，是小儿常见的先天性疾病，80%的隐睾可被触及，20%不可被触及，大约20%不可触及睾丸是睾丸缺如，但是腹腔内温度高，会影响睾丸的发育，在两岁之前做隐睾手术。
鞘膜积液不属于先天性疾病。
如果有大量的液体，可以通过服用药物来进行调节，如果有大量的液体，可以通过微创手术进行穿刺吸收。如果发生了这种情况，一般是因为新生儿出生后，如果没有彻底封闭的话，就会产生大量的液体，这种现象一般发生在一年以内，如果不做任何手术，就会自动消退，但是如果是两年之后，就必须进行外科手术，不然就无法痊愈了。如果发生了这种情况，如果出现了睾丸炎、附睾炎等情况，需要去正规的男科医院进行诊断，根据病因进行处理，一般认为鞘膜积液不是先天的，一般都是后天造成的。
先天性的睾丸癌可以治疗缓解，睾丸肿瘤的治疗分为手术治疗、放射治疗和化学治疗以及综合治疗。一旦确定为睾丸肿瘤，均应先进行睾丸切除术，之后结合病理检查结果决定进一步治疗方案。先天性的睾丸癌也可能复发，术后注意预防。
先天性心脏病属于先天性畸形。
因为胚胎在生长阶段心脏没有得到充分的发展，其原因主要是因为心脏的缺陷，比如心脏的缺陷、动脉导管未闭，如果出现了瓣膜缺陷，或者动脉导管未闭，都可以通过后天来修复，从而恢复如健康的孩子，但如果出现了严重的复杂的先天性心脏病，那么就会出现较大的问题，而且预后也不会很理想，所以在妊娠的时候要定期进行围产期的护理，这样才能发现自己患上了先天性心脏病。
通常情况下，先天性的小脑畸形可以通过手术来治疗。
小脑扁桃体下疝畸形是先天性的，只有手术才能治疗。没有明显的临床表现或只有轻度头痛的病人，通常不需要进行任何的治疗。如果出现了明显的共济失调，比如走路不稳，或者是由于压迫、粘连所致的脑干、颅内神经损伤，就需要进行外科手术。手术方式以头后窝和颈髓减压为主，多数病人在术后症状有明显好转。
