药物流产的伤害小，还是无痛人工流产的伤害小，都是相对而言的，需要根据病人的具体情况来分析。如果病人怀孕是在49天之内没有药物流产的禁忌，选择药物流产伤害最小。因为药物流产只需要使用合适药物和合适药物等药物，就达到流产的目的，不需要进行宫腔的操作，所以对病人子宫内膜损伤是比较小，而且不容易出现大出血，或者是感染等一些并发症，同时药物流产的花费也很少。
怀孕45到55天做人流伤害最小。
一般情况下，在怀孕45到55天时做人流对女性身体的损伤最小，并且最好选择药流，药流要比人流的损伤更小。但是需要注意进行药流之后阴道流血和腹痛的情况，如果出现异常需要考虑药流不净的可能，需要及时到医院进行检查治疗，必要时可进行清宫术。因为子宫内如果存在残留组织的时间过久，会对女性的身体照成很大的危害。
药物流产只适宜怀孕在49天内的早期宫内妊娠，B超检查孕囊的平均直径要小于2.3厘米。女性在怀孕初期是做药流的时间，停经49天以内。若超过49天，是不适合做药流的。而人流的时间在35-45天左右，最迟在12周以内进行人工流产。因为这时子宫不太大，妊娠组织不太多，胎儿也小，容易吸净，手术药流时间短，副反应轻，出血少。
从流产方式上看，药物流产对身体的伤害相对较小，但不管药物流产还是人工流产都会伤害身体。
停经49天以内的孕妇可以采用药物流产，有75%左右的成功率，若药物流产失败，则要做清宫手术，注意清宫手术对身体伤害很大。停经12周以内的孕妇可以进行人工流产，主要是通过局部麻醉，将孕囊、胚胎组织取出体外，手术成功率很高。因此，若成功进行药物流产，对身体伤害相对较小，若药物流产失败，则可能比人工流产手术伤害更大。
怀孕初期药流和人流相比的话药流伤害会小一点。
在怀孕初期，不管药流还是人流都会对人体有一定的损害，但是两者相比药流的伤害会小一点。如果药流顺利就不需要清宫，能减少感染的几率，避免刮宫对子宫内膜造成损伤。但是也有特殊情况，药流不干净有残留，这种就要做清宫术，也会对子宫造成二次伤害。而流产虽然对子宫有一创伤，但是一般不会造成二次伤害。
怀孕40天药流和人流哪个伤害小，无法比较。二者都会对身体产生一定的影响，不能机械的认为哪个伤害小。药流适用于停经49天以内的宫内孕。药流的好处是如果服药之后胎囊可以排出，复查彩超也没有残留，那么可以避免人工流产对子宫内膜的损伤，可以避免术后宫腔粘连的发生。但是如果没有顺利的排出或者复查彩超有残留，是有可能需要清宫的，那么就和人工流产的操作方式基本类似。而且药流由于出血时间长，可能增加感染的风险。人工流产的好处是可以速战速决的解决问题，适用于孕10周以内的宫内孕。但是术后可能会引起宫腔粘连。无论人流和药流，术后都有出血、感染、二次清宫、月经不调、继发不孕的风险。
