没有得到及时治疗，容易出现并发症，使病程迁延难愈。百日咳的并发症有气管炎，支气管炎比较多见的。控制传染源，隔离患儿，对密切接触的易感者检疫21天。按呼吸道隔离，保持空气新鲜，避免一切可诱发痉咳的因素。有并发脑病时可予对症处理。
婴儿百日咳通常是一种发病率较高的呼吸道传染病。
百日咳是一种常见的儿童呼吸道传染病，其特点是阵发性的、痉挛性的咳嗽，常伴有鸡叫样的吸气声。如百日咳不及时处理，还可能并发肺炎、脑病等疾病，容易对婴儿的身体健康造成明显的影响。此外，百日咳的病程较长，一般会持续2-3个多月，对儿童的身体会有很大的影响。所以在儿童出现百日咳时要尽早进行治疗，家长也要保持良好的心态，不要过度焦虑。
百日咳综合症的临床表现就与百日咳是一样的，一般会有初期的上感症状，比如流涕，流眼泪，发烧，轻微咳嗽，随后逐渐咳嗽逐渐加重，在2个周左右出现痉挛性连声咳嗽，以夜间为主，病史较长的咳嗽会导致声带水肿，出现鸡鸣样的尾音，小婴儿有时还会出现口唇青紫甚至窒息。
充足休息多摄入液体，孩子要注意是否有脱水症状。每餐少食以免咳嗽后呕吐，少食，多餐。在房间使用加湿器，注意保持加湿器清洁。保持空气清洁，减少引起咳嗽的刺激，如不要在家吸烟。防止传染，咳嗽时用手臂挡住嘴，勤洗手，去其他的地方时戴口罩。
婴儿百日咳的护理应该注意好孩子的精神状态问题，自己饮食也要清淡，可以给孩子吃一些药物进行治疗。没有效果的话，需要做一个进一步的诊断，可以去检查一个血常规，适当的是需要服用一些抗生素类的药物。
治疗可通过以上方法。对症治疗：婴儿窒息时应即刻行人工呼吸，给氧，必要时给予止痉排痰。并发症治疗：并发肺炎可选用敏感抗生素，并发脑病时可予脱水、止痉等对症处理。
