三个月宝宝吃纯母乳拉肚子需要观察排便形状来判断，如果大便成形度比较好，可以暂时不用处理，如果不成型，可以口服一些药物治疗。平时要注意宝宝腹部的保暖，要控制宝宝饮食的频率和卫生。
这有可能是有肚子受凉或者是有病毒感染引起的这种表现，注意观察，如果感觉症状比较明显，或者是宝宝有明显的脱水症状，应该及时去儿科进一步检查。查明原因然后用药。
三个月婴儿拉稀首先考虑是感染肠炎了，是一种消化功能紊乱的综合征，给孩子喝一些调节孩子肠道的菌群，同时也要给孩子多喝水，保证孩子体内充足的水分，避免孩子造成脱水的现象，注意孩子的保暖，避免孩子受凉加重病情，也要注意让孩子在饮食上做到少量多餐，避免孩子消化不良引起高烧，注意室内温度和湿度的适宜，充分保证宝宝的休息。
一般来说，宝宝拉肚子母乳喂养要注意以下事项。
宝宝拉肚子母乳喂养多给宝宝多饮水，避免出现缺水的情况，如果出现了肠道炎症，需要在医生的指导下口服抗炎药物，可以缓解病情，平时家长多给宝宝做一些腹部的推拿。
家长应该让患儿注意休息，保持环境安静，饮食宜清淡、易消化、富含营养，适当到户外活动，加强体格锻炼，增加抗病能力。
不会影响到宝宝，可以继续母乳喂养。但是如果一些母亲是有比较严重的腹泻性疾病、感染性疾病，像细菌性痢疾或者是某些特殊的病毒感染，暂停母乳喂养，可以暂时进行人工喂养。
幼儿的身体器官发育不完善，消化系统和免疫系统都还不健全，很容易受到细菌或者病毒的感染，从而引起拉肚子的现象。如果拉肚子不止，应考虑进行药物治疗，如果有脱水症状，还需及时的注射生理盐水来补充体内水分平衡。如果拉肚子不严重，可不使用药物治疗。要注意宝宝腹部的保暖，可以用热毛巾捂住宝宝的肚子，要控制宝宝饮食的频率，注意宝宝的卫生情况，经常给宝宝擦拭手和脸部。