发现脐尿管囊肿之后，应该控制局部感染。手术切除脐尿管，绕脐切开皮肤，进入腹腔后，延壁层腹膜寻找到连接至膀胱顶部的条索状的漏管，尽量的游离至膀胱壁部结扎然后完整地切除脐尿管。
一般情况下，脐尿管囊肿可以通过手术来治疗，具体内容如下：
脐尿管囊肿位于脐下正中腹壁，位于腹横筋膜与腹膜之间，其原因是脐尿管两侧封闭，而中央不闭，脐尿管上皮分泌的液体。如果出现脐尿管囊肿的情况，建议患者及时去医院就诊，脐尿管囊肿的常见治疗方式为：摘除囊肿，目前可以通过微创外科手术或腹腔镜手术进行治疗。
脐尿管囊肿可以通过手术进行治疗，具体分析如下：
如果是单侧脐尿管瘘是在肚脐处开口的，多见于肚脐红肿伴有脓性分泌物及肚脐附近疼痛。如果是脐带和膀胱相连的脐带，可有尿液从脐带流出，并伴有感染。如果是脐尿管囊肿，在中间有囊性结构，通常伴随着疼痛和感染。这三种都需要外科手术。经手术后，脐尿管和囊肿全部游离出来，全部切除后痊愈。
脐尿管囊肿临床少见，多发生于男性，囊肿位于脐带下腹壁正中的深部，位于横筋膜和腹膜之间。是由于脐尿道两端闭合，形成由脐尿道上皮分泌的液体，其中大部分是在儿童时期发现的，脐囊肿是位于下腹中部的囊性肿块，不随体位的改变而改变，囊肿的表面位置与腹壁密切相关，巨大的囊肿类似于腹腔内肿瘤，可压迫肠道，引起腹痛等症状，由于继发性感染，也可能成为脓肿，脓肿或囊肿可破裂，向外穿孔，或破裂至膀胱或腹腔及盆腔。
脐尿管囊肿可以通过手术进行切除，具体分析如下：
如果孩子患有脐尿管囊肿，可能会出现皮炎、局部囊肿反复发作、泌尿系统感染等症状。正常脐尿管在出生后会发生退化，如果退化不全，会导致尿管漏、气尿管囊肿、脐尿漏等。如果囊肿比较小，或者是在身体检查时没有出现异常的表现，需要进一步的观察。在观察的时候，如果囊肿快速扩大，并且有脐部感染，或反复出现尿路感染，可以通过手术切除来治疗。