一般来说，打乙脑疫苗后发烧39度的原因如下：
疫苗的副作用可能会导致患者出现打乙脑疫苗后发烧39度的情况。正常情况下，发烧症状的时间不会持续太久，基本会在3天内缓解。口服布洛芬混悬液，多喝温水以及温水擦拭身体的物理降温方式都可以有效改善症状。
日常生活中，患者应注意多休息，避免过度劳累，保持心态平和，不要有太大的精神压力，还要注意个人饮食，多吃新鲜的蔬菜和水果，保证营养均衡，有利于身体恢复。
麻风疫苗和乙脑疫苗可以一起打，但一般不提倡一起打。麻风疫苗主要是为了预防麻疹和风疹，乙脑疫苗主要是为了预防流行性乙型脑炎。不提倡一起打是因为患儿在接种疫苗后，有时会出现不良反应和过敏反应。临床常见的有接种部位局部红肿、硬结、发热、腹痛、食欲不振等。若患儿同时接种两种疫苗可能会加重不适症状。
乙脑疫苗建议在5月份进行接种，夏季是乙脑疾病高发的季节，5月份打完乙脑疫苗后一个月左右基本身体就有抗体，因此这是比较合适的时间，7-9月不太适合打乙脑疫苗，这时候是乙脑高发的季节，接种是不太合适的。乙脑疫苗多注射两针，注射完可能会有发烧的情况，这是需要注意的。
一般情况下，宝宝接种了疫苗之后会发热，要根据发热的具体情况进行分析，比如咳嗽、打喷嚏、流鼻涕等，可以考虑是上呼吸道的疾病，可以口服小儿氨酚黄那敏颗粒、小儿头孢克肟、鲜竹沥口服液等药物进行治疗；宝宝出现腹泻、呕吐等症状时，可以口服妈咪爱、蒙脱石散、乳酸菌素片等药物进行治疗。体温38.5摄氏度以上要吃退烧药，没有明显的表现，可能是因为打了一针流感引起的发热，可进行物理降温。
由于神经髓鞘化发育不全，小孩子在发作过一次高热惊厥后，是可能会因感染、炎症等因素刺激，使神经细胞暂时性功能紊乱，从而反复出现高热惊厥现象。但多数孩子在6岁之后，随着神经系统的完善，通常不会再反复出现高热惊厥。
家长为预防小儿高热惊厥反复发作，在孩子感染、发热期间需做好退热护理，利用退热贴、温水擦浴等方式降低体温，多给孩子饮用温水，保持足量的新鲜蔬果摄入。如果发热较严重，需及时遵医嘱给孩子应用退热药物治疗。此外，为减轻惊厥再次发作带来的身体受损风险，建议家长咨询专业医师后，家中常备苯二氮卓类药物，如咪达唑仑口颊粘膜溶液。当孩子高热惊厥发作所致身体抽搐、意识不清等症状持续超过2分钟时，可及时给药治疗，其溶液性质剂型稳定，可在口颊粘膜处给药，药物吸收利用率高，约4~8分钟后即可起效，能够迅速地阻断大脑异常放电，缓解孩子惊厥发作所致各类症状，避免神经系统受损风险加重。
同时，想要预防反复高热惊厥发作所致风险，家长还需做好宝宝的生活护理，尽量减少或避免急性发热疾病，如上呼吸道感染、扁桃体炎等。
在惊厥发生后短期内不宜接种乙脑、流脑、百白破疫苗。即使打其他疫苗也要注意，因为疫苗本身就是各种传染病的病原体减毒或灭活后制成的，不具有毒性只是具有抗原性的，能够刺激机体产生抗体，所以个体差异会引起不同的反应，有惊厥史的孩子较敏感，会产生较重的反应，所以不能打。
