应该是怀疑肺炎支原体感染，咳嗽，有浓痰都是肺炎支原体感染的表现，还是因为呼吸系统有感染。在夜间的时候，呼吸系统会分泌炎性的分泌物，也就是痰液，容易积聚在呼吸道内，比如支气管或者肺泡内。在早晨起来之后机体为了排出炎性的物质或者痰液，所以会咳嗽的比较厉害，有利于炎性物质的排出。
两个月的宝宝早晨起床有点咳嗽，可考虑分泌物或是轻度感冒的可能。可以定期给宝宝清理鼻腔分泌物，注意量体温看看，只要没有发热，症状不加重就先不要吃药。要给宝宝多喝水，注意保暖，不要吹风。
一般情况下，儿童早晨咳嗽可能是支气管发炎造成的，具体内容如下：
如果儿童存在支气管发炎的情况，可能会导致儿童的呼吸道中大量的痰，而夜间睡觉时，儿童通常采取仰卧的姿态，这样不仅不能排出痰，还会导致支气管里积累了很多的痰液。儿童早晨起后，痰液会在引力的影响下慢慢聚集，从而引起咳嗽。但是，因儿童夜间喝水较少，所以清晨咳嗽时痰多且粘腻，难以咯出，常以顿咳为主。
可能与孩子呼吸道病毒或细菌感染有关系，导致感冒或支气管炎的发生。也可能鼻炎所致，是需要进行积极的治疗的。可带孩子到医院儿科就诊，进一步检查明确病因及病变程度，然后采取合理的治疗方法。
每天早上咳嗽要结合病人的年龄和基础疾病来判断。老年病人或者慢性支气管炎病人，经过一夜的睡眠后，晨起的痰比较多，通常会咳出白色泡沫痰。另外，咳嗽变异性哮喘病人，在清晨也有会咳嗽的症状。
