乙脑的症状，主要包括潜伏期的症状、初期的症状、极期的症状以及恢复期的症状。潜伏期大约为2-3周，没有很典型的症状。在初期，大约3-5天，主要表现为发热、头疼、呕吐、呼吸道症状。
乙脑病毒是乙型脑炎病毒的简称，当进入人体的乙脑病毒数量较多，毒性较强，被感染者机体免疫力弱的时候，乙脑病毒就会侵入人体的中枢神经系统，使被感染者患上流行性乙型脑炎。乙脑病毒可以引起脑实质病变，故流行性乙型脑炎患者常表现为高热，意识障碍，严重的时候可能会导致全身抽搐，呼吸衰竭，甚至死亡。
乙型脑炎是由乙脑病毒引起的自然疫源性疾病，经蚊媒传播，流行于夏秋两季。无明显前驱症状，可有发热、食欲不振、轻度嗜睡、大儿童咳嗽药头痛，婴幼儿可出现腹泻。药物治疗为肾上腺皮质激素及其他治疗，对重症和早期确诊的即可应用，待体温静至38摄氏度以上持续两天即可逐渐减量，不宜超过七天。
打了乙脑疫苗后发烧属于很常见的不良反应，要根据孩子体温高低进行处理，体温小于38.5℃可物理降温，大于38.5℃需口服退烧药。一般这种原因造成的发烧症状会在24小时之后恢复正常。接种的疫苗是一种减毒或灭活疫苗，这种疫苗注射后，人体会产生一定的排斥反应，而发烧是人体的一种对抗病原微生物感染入侵的有益的保护性机制，这是人体在自我保护的行为，是属于正常的接种疫苗后的不良反应。
乙脑炎的症状通常是反应速度变慢、记忆力见图等。
乙型脑炎病毒可能会导致乙型脑炎的发生，通常会影响到中枢神经。乙型脑炎的临床症状通常取决于病变的位置和病变的范围。如果是额叶，颞叶病灶发生病变，通常会有精神上的不正常的情况，患者的反应也比较慢。如果是额叶、顶叶、颞叶的病变，可能会导致癫痫的发生。也有部分患者出现海马体受累的情况，可能会导致认知能力的减退，出现记忆力减退，计算能力下降的现象，时间和空间定向力也会受到影响，甚至会出现偏侧肢体的活动不灵活，偏侧肢体的麻木等症状。
