巧克力囊肿子宫内膜异位症的一种，是外源性子宫内膜异位症的一种，这种病在西医上北称为：“不死的癌症”是一种经久反复的疾病。这种病中医保守治疗。中医保守治疗只要对症就能见效，中医保守治疗后复发率低。对于有生育要求的，建议中医保守治疗。
巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢引起的。如果囊肿较大超过5厘米，需要行手术治疗。手术后要适当下床活动，防止肠黏连，同时要加强营养，增加蛋白质的摄入，有利于伤口的愈合，平时要加强个人卫生，保持会阴部清洁干爽。
多囊卵巢综合症属于妇科内分泌疾病所致，一般是伴随激素分泌异常所致的，此病到目前为止是不能康复的，但是可以控制疾病的发展。还是需要尽早针对病因治疗的，常用药物都是可以的。
卵巢巧克力囊肿的治疗方法有以下几种。药物治疗，可以选择手术治疗，可以选择腹腔镜或者是开腹卵巢巧克力囊肿剥除术，手术之后还是需要使用西药进行巩固。可以选择彩超引导下的穿刺手术。
术后注意调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常，手术后注意增加蛋白质的摄入量。蛋白质可以帮助伤口快速好，可以增加体力。选择鱼类，鱼肉比较容易消化和吸收。注意休息，禁食辛辣生冷刺激东西，适当活动，增强身体抵抗力。
卵巢巧克力囊肿不能自愈。现在有巧克力囊肿的情况，不能治疗，如果现在囊肿比较小，可以服用药物进行治疗。是子宫内膜异位症的，就是进行性的痛经，可以药物或者手术治疗的。