跖疣的治疗可以通过局部手术来完成，而对于较小的状态可以使用局部激光或微波来去除疣。经过激光或冷冻或微波治疗后，局部皮肤会出现坏死和感染的可能性。要及时用碘伏进行局部消毒，防止感染。
疣多由人类乳头瘤病毒感染引起，可以通过皮肤的微小破损自身接种传染，从而越来越多，是具备传染性的，发现就要尽早治疗。治疗的方法主要有：药物治疗；光动力学疗法，系统或局部外用光敏剂，光照后引起局部细胞死亡，可治疗部分寻常疣、尖锐湿疣；物理疗法，冷冻疗法、电灼疗法、激光治疗、红外凝固治疗适用于数目少的寻常疣和跖疣。个别巨大疣体可行手术切除术。
冷冻治疗疣后，应注意保持伤口清洁干燥。一个星期内不要碰水。喜欢游泳、洗澡和洗澡的朋友应该多加注意。不要洗澡，以免继发感染。要强调的是，不能对患病部位进行扣扎、撕裂或擦洗。如果多加注意，大约一周跖疣会留下疤痕，当疤痕脱落时，就好了。
治疗上相对并不是很贵，找一些皮肤科或者就是脚科就可以处理这些问题了。可以有多种方式，比如说可以进行冷冻的，这个也可以通过一些抗病毒的药物治疗。平时注意卫生多吃青菜水果。
尖锐湿疣可以中西医结合治疗。西医的常规手段有常见的手术治疗对疣体组织切除、冷冻治疗使用低温冷冻使疣组织坏死、激光治疗用烧灼使疣体脱落；还有中医的药物治疗，外部熏洗、涂抹等。
