化脓性扁桃体炎，首先，需要抗炎、抗感染治疗。因为扁桃体已成为脓性、脓栓等表现，同时，可配合相关药物。如果伴随有扁桃体周围脓肿，需要做切开引流治疗，配合治疗。如果出现憋喘，需加用激素类的药物。
怎样治疗化脓性扁桃体炎，化脓性扁桃体炎多数是溶血性链球菌感染，采用有效抗菌素治疗，一般疗程不少于十天。化脓性扁桃体炎是由于扁桃体侵入了微生物或病原菌等导致的化脓性的感染。
化脓性扁桃体炎会传染，乙型溶血性链球菌为本病的主要致病菌，非溶血性链球菌、葡萄球菌、肺炎链球菌、流感杆菌及腺病毒等也可引起，细菌和病毒混合感染者也较多见。这些病原体存在于正常人的口腔及扁桃体内而不致病。
通常情况下，对于儿童化脓性扁桃体炎，可以选用一些抗生素进行抗感染的药物。
常见的有阿莫西林、克洛干混悬剂、青霉素、头孢等。对青霉素、阿奇霉素、克拉霉素等药物有敏感反应。
宝宝要多喝水，平时的食物要以清淡的方式来消化。化脓性扁桃体炎不仅会导致咽痛，还会导致发烧。如果宝宝的温度在38℃以上，可以服用一些退烧药。
一般来说，儿童化脓性扁桃体炎，发烧至38℃以上应给予退烧药物，可以在医生指导下使用布洛芬混悬剂，并叮嘱儿童多饮水，多休息，出汗后要换内衣裤。另外还要进行抗炎的治疗，可以在医生指导下使用蒲地兰消炎口服液和阿莫西林克拉维酸钾胶囊，三日后仍不见起色，建议进行全身注射，化脓性炎症不能完全控制，可以静脉给药。
此外，如果儿童化脓性扁桃体炎的情况比较严重，建议及时前往医院就诊治疗。
小儿化脓性扁桃体炎主要是以抗炎、抗感染、对症治疗急性的炎症症状为主。若患儿病情反复，可诊断为慢性扁桃体炎，则在炎症被控制两周时间后，即非急性期进行手术切除治疗。