一般情况下，如果患者的卵巢囊肿为生理性囊肿，卵巢囊肿CA125通常不会高；如果是病理性的则可能会高，具体内容如下：
CA125是一种糖蛋白复合物，有助于诊断患者的疾病，而卵巢囊肿CA125是否会增高需要根据其类型进行判断，并不能笼统地一概而论。如果女性体内存在生理性的卵巢囊肿，如卵巢滤泡囊肿、卵巢黄体囊肿等，此时，CA125通常不会比较高。但是，如果患者患有子宫内膜异位症、结核性腹膜炎等病症，检查结果可能会提示CA125偏高。
一般情况下，良性卵巢囊肿可能会导致CA125轻微升高，具体分析如下：
良性卵巢囊肿有可能会导致CA125出现轻度升高，一般是由于卵巢巧克力囊肿导致的。结合病史，如果有痛经的病史并且进行性加重，还可能会不孕不育，另外半个月再复查的时CA125值没有改变，基本上就可以考虑是卵巢巧克力囊肿。
对于卵巢巧克力囊肿患者，建议尽快手术治疗，术后为了预防复发还要用相应的药物，连续用药三个月经周期或半年的时间。
卵巢囊肿会导致CA125增高，CA125是一种常见于卵巢上皮癌的肿瘤标志物，这种病人在检查时会出现CA125高于正常值。但在某些特定的条件下，也会引起盆腔炎、子宫内膜异位症、卵巢囊肿等疾病，特别是50岁以下的女性，CA125增高并不一定就是卵巢癌。女性50岁以上的女性，CA125水平增高，需要密切关注。
怀孕有卵巢囊肿可能是正常的。
卵巢囊肿是卵巢表面或内部出现的含有液态或固态物质的囊状结构。如孕前查无卵巢囊肿，妊娠后出现卵巢囊肿属正常现象，认为是黄体囊肿。怀孕妇女尤其早孕，卵巢可出现生理性黄体囊肿，主要保持妇女怀孕，分泌雌激素、孕激素。黄体囊肿也可以发生在输卵管或者子宫中，而不只是局限于阴道或宫颈。通常妊娠3个月后，卵巢中胎盘组织可代替卵巢中黄体囊肿。
卵巢囊肿是很常见的，卵巢囊肿的直径小于5个厘米，可以口服药物进行控制卵巢囊肿的生长。如果卵巢囊肿的直径大于5个厘米，就需要进行手术剔除卵巢囊肿的。手术后注意保养，注意局部卫生，每天要用清水清洗外阴。
